50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1844 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 
612 aa  1239    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  39.02 
 
 
600 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  35.05 
 
 
586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  32.12 
 
 
689 aa  234  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  41.05 
 
 
641 aa  232  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  30.89 
 
 
624 aa  216  8e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  29.85 
 
 
696 aa  216  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  31.16 
 
 
599 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  28.82 
 
 
687 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  28.79 
 
 
1179 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  32.57 
 
 
693 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  30.24 
 
 
684 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  33.05 
 
 
674 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  27.56 
 
 
688 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  27.53 
 
 
1156 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  28.12 
 
 
651 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  28.12 
 
 
651 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  29.1 
 
 
652 aa  128  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  31.52 
 
 
667 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  28.51 
 
 
669 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  31.23 
 
 
668 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  31.23 
 
 
640 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  28.51 
 
 
689 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  30 
 
 
684 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  30 
 
 
684 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  29.7 
 
 
683 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  31.86 
 
 
780 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  27.69 
 
 
391 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  28.38 
 
 
620 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  30.68 
 
 
780 aa  107  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  27.22 
 
 
671 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  30.06 
 
 
770 aa  100  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  26.1 
 
 
656 aa  97.1  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  23.24 
 
 
623 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  26.82 
 
 
591 aa  95.1  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  42.48 
 
 
663 aa  92.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  28.96 
 
 
624 aa  73.9  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  28.96 
 
 
624 aa  73.9  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  26.69 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  30.71 
 
 
624 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  30.71 
 
 
624 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3410  hypothetical protein  34.78 
 
 
601 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581563  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1157  peptidase U35 phage prohead HK97  27.73 
 
 
286 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206732  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  31.25 
 
 
299 aa  54.7  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.248362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  31.79 
 
 
231 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  34.34 
 
 
240 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  33.04 
 
 
186 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  31.17 
 
 
167 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3411  hypothetical protein  29.28 
 
 
178 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  31 
 
 
156 aa  43.9  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>