More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0107 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  100 
 
 
403 aa  815    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  71.25 
 
 
403 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  67.74 
 
 
405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  51.83 
 
 
413 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  46.65 
 
 
408 aa  362  5.0000000000000005e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  49.35 
 
 
396 aa  342  9e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  51.04 
 
 
404 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  38.1 
 
 
404 aa  269  7e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  37.04 
 
 
404 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  36.18 
 
 
404 aa  263  6e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  36.77 
 
 
403 aa  263  6e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  36.51 
 
 
404 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  39.43 
 
 
441 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  39.74 
 
 
414 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  39.39 
 
 
401 aa  252  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  38.74 
 
 
399 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  37.69 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.71 
 
 
415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  37.04 
 
 
416 aa  241  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  37.16 
 
 
401 aa  239  9e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  35.06 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  36.91 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  34.35 
 
 
414 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  35.06 
 
 
421 aa  228  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  32.91 
 
 
404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  33.25 
 
 
454 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  33.94 
 
 
441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  32.3 
 
 
434 aa  212  9e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  32.73 
 
 
437 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  36.73 
 
 
423 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  32.65 
 
 
430 aa  209  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  38.05 
 
 
427 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  36.86 
 
 
422 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  37.56 
 
 
419 aa  206  8e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  31.61 
 
 
412 aa  199  6e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  34.18 
 
 
422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  31.36 
 
 
419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  32.3 
 
 
432 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  32.3 
 
 
432 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  33.6 
 
 
437 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  33.85 
 
 
428 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  33.85 
 
 
391 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  37.66 
 
 
459 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  33.85 
 
 
425 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  36.03 
 
 
397 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  31.84 
 
 
425 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  36.15 
 
 
402 aa  189  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  33.33 
 
 
424 aa  189  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  32.48 
 
 
408 aa  188  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  33.5 
 
 
439 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.67 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  33.68 
 
 
421 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  32.56 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  32.73 
 
 
416 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  33.33 
 
 
413 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  35.86 
 
 
396 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  31.04 
 
 
419 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  34.62 
 
 
424 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  37.46 
 
 
356 aa  177  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  33.25 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  32.66 
 
 
353 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  31.25 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  32.66 
 
 
353 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  33.33 
 
 
426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  35.01 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  33.53 
 
 
354 aa  173  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  30.67 
 
 
418 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  34.59 
 
 
403 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  32.2 
 
 
408 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  31.55 
 
 
432 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  34.87 
 
 
331 aa  169  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  31.77 
 
 
411 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  30.75 
 
 
429 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  33.94 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.25 
 
 
375 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  36.73 
 
 
347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  29.97 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  36.53 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  32.31 
 
 
428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  33.24 
 
 
353 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  33.7 
 
 
420 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.83 
 
 
358 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  33.94 
 
 
348 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  35.06 
 
 
351 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  32.11 
 
 
349 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  32.02 
 
 
351 aa  159  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  35.76 
 
 
352 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  35.84 
 
 
352 aa  159  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  31.31 
 
 
373 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4420  threonine synthase  33.85 
 
 
420 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  36.06 
 
 
352 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  34.97 
 
 
353 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0665  threonine synthase  31.25 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  34.04 
 
 
348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  35.76 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  35.45 
 
 
352 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  35.76 
 
 
352 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  35.76 
 
 
352 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0942  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.33 
 
 
408 aa  155  9e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  35.45 
 
 
352 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>