76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0045 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0045  outer membrane efflux protein  100 
 
 
370 aa  739  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00077566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2120  outer membrane protein-like protein  34.02 
 
 
374 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000810254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2342  Outer membrane protein-like  31.13 
 
 
333 aa  139  9e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4152  Outer membrane protein-like protein  29.19 
 
 
366 aa  131  2e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.01728e-08  hitchhiker  3.5562e-07 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0134  hypothetical protein  26.29 
 
 
394 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.63159e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3141  hypothetical protein  24.92 
 
 
359 aa  71.6  2e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 
443 aa  70.1  6e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 
488 aa  57.4  4e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.04 
 
 
488 aa  57  5e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.04 
 
 
497 aa  57  5e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  24.18 
 
 
448 aa  56.6  7e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.76987e-07  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 
497 aa  55.5  1e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  24.29 
 
 
461 aa  54.7  3e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.88 
 
 
441 aa  53.5  6e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 
420 aa  53.5  6e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1063  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 
348 aa  52.8  1e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  21.62 
 
 
434 aa  52.4  1e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.35514e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  27.39 
 
 
435 aa  52  1e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  21.36 
 
 
441 aa  52  2e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  33.96 
 
 
569 aa  50.8  3e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.78 
 
 
491 aa  50.8  3e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.71 
 
 
435 aa  50.8  3e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.67 
 
 
463 aa  50.4  4e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  27.04 
 
 
435 aa  50.8  4e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.09945e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 
435 aa  50.8  4e-05  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  25 
 
 
490 aa  50.4  5e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  26.28 
 
 
435 aa  50.4  5e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  5.55232e-06  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.86 
 
 
489 aa  50.4  5e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.2 
 
 
464 aa  50.1  6e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  26.11 
 
 
435 aa  50.1  6e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  4.56355e-08  hitchhiker  5.11139e-05 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.78 
 
 
463 aa  50.1  6e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  26.67 
 
 
457 aa  49.7  7e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  25.6 
 
 
441 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  9.83275e-07  unclonable  1.04798e-10 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  25.64 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  6.21601e-07  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.1 
 
 
487 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  25.64 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.08694e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  26.11 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.45313e-06  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.62 
 
 
522 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  25.64 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.84345e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.59 
 
 
480 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  25.64 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.13836e-08  hitchhiker  8.82186e-11 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  29.13 
 
 
514 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.59 
 
 
478 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  25.64 
 
 
432 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  9.73822e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.68 
 
 
493 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  26.36 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  6.11538e-05  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.04 
 
 
539 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.01 
 
 
450 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 
1496 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.21 
 
 
512 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  20.29 
 
 
432 aa  47  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.29322e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.22 
 
 
441 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.8 
 
 
471 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.71 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.35 
 
 
514 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.35 
 
 
514 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.65 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.25 
 
 
468 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.65 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  6.68163e-08 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.93 
 
 
553 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 
472 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  26.83 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.82 
 
 
497 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  29.06 
 
 
437 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1764  Outer membrane protein-like protein  22.19 
 
 
362 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00913626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  32.35 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.44 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.27 
 
 
442 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.47 
 
 
470 aa  43.5  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.24 
 
 
518 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 
426 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.26 
 
 
497 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.75 
 
 
434 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  23.76 
 
 
1470 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>