80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1791 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
392 aa  811    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  38.18 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  38.34 
 
 
384 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  30.55 
 
 
413 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  30.91 
 
 
367 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  31.04 
 
 
367 aa  156  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  31.12 
 
 
392 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  31.23 
 
 
376 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  30.71 
 
 
373 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  30.91 
 
 
367 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  33.21 
 
 
366 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  33.21 
 
 
366 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  33.85 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  33.72 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  33.85 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  33.72 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  33.72 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  32.84 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  28.72 
 
 
365 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  33.46 
 
 
366 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  33.46 
 
 
366 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 
366 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  29.49 
 
 
366 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  29.26 
 
 
365 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  33.98 
 
 
385 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  28.46 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  29.84 
 
 
393 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  29.22 
 
 
373 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  29.92 
 
 
354 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  29.21 
 
 
354 aa  133  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  33.19 
 
 
348 aa  130  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  33.46 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  33.45 
 
 
385 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  31.64 
 
 
389 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  30.51 
 
 
380 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  32.55 
 
 
389 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  32.76 
 
 
346 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  31.3 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  25.89 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  25.89 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  30.54 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  29.78 
 
 
369 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  29.28 
 
 
379 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  32.3 
 
 
367 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  28.62 
 
 
360 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  28.3 
 
 
360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  32.86 
 
 
348 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  29.58 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  24.43 
 
 
388 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.71 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  25.12 
 
 
387 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  24.73 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.125717 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  23.22 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  25.64 
 
 
748 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  28.8 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  22.3 
 
 
394 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  22.55 
 
 
394 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  22.17 
 
 
408 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  21.98 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  23.05 
 
 
934 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  21.73 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.73 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  21.73 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  21.73 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  21.64 
 
 
399 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.73 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  23.01 
 
 
439 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  21.48 
 
 
394 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  20.72 
 
 
405 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  20.75 
 
 
394 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  24.17 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  21.78 
 
 
398 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  24.57 
 
 
414 aa  49.7  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  24.57 
 
 
414 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  23.96 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  25.53 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  25.43 
 
 
402 aa  46.6  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  21.18 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  20.9 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  26.55 
 
 
454 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>