More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0626 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0626  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 
391 aa  771    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0380375  decreased coverage  0.00188207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0875  thiolase  76.68 
 
 
391 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  70.36 
 
 
391 aa  544  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7930  3-oxoadipyl-CoA thiolase  71.47 
 
 
391 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155909  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0619  acetyl-CoA acetyltransferase  64.07 
 
 
407 aa  488  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1013  acetyl-CoA acetyltransferases  63.68 
 
 
404 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0223058  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4593  acetyl-CoA acetyltransferase  60.86 
 
 
404 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3849  acetyl-CoA acetyltransferase  60.51 
 
 
405 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4073  acetyl-CoA acetyltransferases  61.79 
 
 
399 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23240  acetyl-CoA acetyltransferase  61.03 
 
 
400 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554052  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0164  acetyl-CoA acetyltransferase  55.64 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0115  acetyl-CoA acetyltransferase  54.01 
 
 
384 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.286312  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  58.23 
 
 
404 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.33 
 
 
424 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  54.11 
 
 
402 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  53.81 
 
 
403 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.14 
 
 
402 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 
401 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  53.12 
 
 
402 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.39 
 
 
401 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.39 
 
 
401 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.14 
 
 
401 aa  381  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.39 
 
 
401 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  48.75 
 
 
404 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.66 
 
 
400 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  52.41 
 
 
398 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
400 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  51.63 
 
 
402 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.37 
 
 
403 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  50.63 
 
 
398 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.14 
 
 
401 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.13 
 
 
401 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.88 
 
 
401 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.75 
 
 
401 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.76 
 
 
402 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.14 
 
 
400 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.26 
 
 
402 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  50.88 
 
 
398 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.63 
 
 
402 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  51.73 
 
 
408 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.63 
 
 
402 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.62 
 
 
401 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.77 
 
 
402 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.76 
 
 
400 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.15 
 
 
401 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.38 
 
 
401 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.77 
 
 
399 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.75 
 
 
400 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.53 
 
 
406 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.63 
 
 
400 aa  359  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.13 
 
 
401 aa  359  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.63 
 
 
400 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.88 
 
 
400 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.26 
 
 
401 aa  359  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  48.36 
 
 
399 aa  358  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.26 
 
 
400 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.76 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.65 
 
 
406 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.63 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.63 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52 
 
 
402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.51 
 
 
402 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.87 
 
 
400 aa  355  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.48 
 
 
404 aa  355  7.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1034  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.26 
 
 
400 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0157191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.51 
 
 
401 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.88 
 
 
400 aa  354  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.74 
 
 
404 aa  354  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  52.15 
 
 
399 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.5 
 
 
402 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.13 
 
 
400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  54.14 
 
 
412 aa  352  5.9999999999999994e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.99 
 
 
401 aa  352  7e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.38 
 
 
400 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.38 
 
 
397 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.9 
 
 
399 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.65 
 
 
400 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.63 
 
 
401 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.38 
 
 
400 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.13 
 
 
401 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.37 
 
 
400 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.63 
 
 
405 aa  349  5e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.13 
 
 
401 aa  348  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.26 
 
 
401 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1169  acetyl-CoA acetyltransferase  47.12 
 
 
400 aa  348  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.178123 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.52 
 
 
400 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 
402 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.63 
 
 
400 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.12 
 
 
401 aa  346  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  50 
 
 
409 aa  345  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.9 
 
 
406 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.48 
 
 
412 aa  345  7e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.12 
 
 
400 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1236  acetyl-CoA acetyltransferase  46.87 
 
 
400 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.439957  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 
405 aa  345  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.01 
 
 
401 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.26 
 
 
400 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.85 
 
 
414 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.64 
 
 
402 aa  343  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.64 
 
 
406 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>