69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1619 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 
437 aa  889    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  63.16 
 
 
490 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  39.64 
 
 
439 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  38.53 
 
 
435 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  41.91 
 
 
444 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  30.98 
 
 
466 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  39.06 
 
 
393 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  27.36 
 
 
431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  24.24 
 
 
649 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  25.26 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  25.52 
 
 
397 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  24.89 
 
 
446 aa  91.3  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  24.87 
 
 
400 aa  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  23.66 
 
 
646 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  25.89 
 
 
659 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  23.76 
 
 
405 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  25.57 
 
 
659 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  23.95 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  22.68 
 
 
645 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  22.68 
 
 
645 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  22.68 
 
 
645 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  25.46 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  28.69 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  25 
 
 
661 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  25 
 
 
661 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  25.5 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  25.78 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  27.53 
 
 
624 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  27.53 
 
 
624 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  27.18 
 
 
624 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  27.18 
 
 
624 aa  63.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  26.03 
 
 
403 aa  63.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  27.59 
 
 
425 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  21.73 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  23.1 
 
 
413 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  24.14 
 
 
466 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  25 
 
 
469 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  25.58 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  25.58 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  22.73 
 
 
438 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  23.2 
 
 
389 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  24.17 
 
 
400 aa  56.6  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  24.64 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  22.19 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  25.19 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  22.9 
 
 
781 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  23.99 
 
 
384 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  28.62 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  22.68 
 
 
279 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  20.73 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  26.69 
 
 
441 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2974  putative major phage head protein/prohead proteinase  25.43 
 
 
360 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594334  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  22.39 
 
 
411 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  29.04 
 
 
431 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  26.45 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0958  putative major phage head protein/prohead proteinase  24.44 
 
 
357 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0701578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  23.4 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  23.4 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  19.35 
 
 
346 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  19.35 
 
 
359 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  25.38 
 
 
430 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  26.46 
 
 
407 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  25.75 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  24.23 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  23.32 
 
 
282 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  27.13 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  25.46 
 
 
386 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  25.64 
 
 
315 aa  43.9  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  30.28 
 
 
417 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>