35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1640 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  869    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  41.8 
 
 
649 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  39.82 
 
 
659 aa  289  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  40 
 
 
659 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  39.91 
 
 
645 aa  282  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  39.91 
 
 
645 aa  282  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  39.91 
 
 
645 aa  282  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  40.69 
 
 
646 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  34.98 
 
 
446 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  36.99 
 
 
661 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  36.99 
 
 
661 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  35.76 
 
 
469 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2184  peptidase U35, phage prohead HK97  38.76 
 
 
177 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000692792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2974  putative major phage head protein/prohead proteinase  30.75 
 
 
360 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594334  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0958  putative major phage head protein/prohead proteinase  29.2 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0701578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  28.46 
 
 
437 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  24.42 
 
 
490 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  24.2 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  27.69 
 
 
525 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  26.42 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  24.78 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  29.07 
 
 
624 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  28.51 
 
 
624 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  28.51 
 
 
624 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  28.76 
 
 
624 aa  53.5  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  23.39 
 
 
444 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  23.15 
 
 
472 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  31.11 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  27.12 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  23.41 
 
 
279 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  22.91 
 
 
397 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  22.47 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  34.78 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  27.82 
 
 
393 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  25.94 
 
 
781 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.792634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>