56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1753 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 435 aa  880    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  76.2 
 
 		 439 aa  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  41.04 
 
 		 490 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  38.76 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  32.67 
 
 		 444 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  33.55 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  30.97 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  26.32 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  24.58 
 
 		 649 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  26.13 
 
 		 659 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  25.58 
 
 		 645 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  25.58 
 
 		 645 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  25.58 
 
 		 645 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  25.78 
 
 		 659 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  24.2 
 
 		 431 aa  86.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  25.31 
 
 		 661 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  25.31 
 
 		 661 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  25.42 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  24.31 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  23.91 
 
 		 646 aa  72.4  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  21.3 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  25.54 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  26.17 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  26.17 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  26.3 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  24.66 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  22.92 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  26.54 
 
 		 781 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  25.84 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  23.78 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  22.95 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  23.71 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  22.75 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  22.55 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  20.73 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  24.81 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  26.1 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  21.17 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  25.85 
 
 		 514 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  25.57 
 
 		 466 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  23.47 
 
 		 337 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  23.39 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  23.45 
 
 		 386 aa  49.3  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  24.35 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1985  phage major capsid protein, HK97  28.46 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  23.37 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  22.8 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  22.8 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  25.6 
 
 		 385 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  24.77 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  23.39 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  21.21 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2866  phage major capsid protein, HK97  28.52 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  24.65 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  23.49 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  21.19 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>