19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2974 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2974  putative major phage head protein/prohead proteinase  100 
 
 
360 aa  710    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594334  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0958  putative major phage head protein/prohead proteinase  77.97 
 
 
357 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0701578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  35.6 
 
 
661 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  35.6 
 
 
661 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  32.53 
 
 
659 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  32.53 
 
 
659 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  32.77 
 
 
649 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  34.97 
 
 
469 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  31.86 
 
 
646 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  32.45 
 
 
446 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  30 
 
 
645 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  30 
 
 
645 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  30 
 
 
645 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  30.75 
 
 
431 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2184  peptidase U35, phage prohead HK97  31.85 
 
 
177 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000692792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  30.11 
 
 
409 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  26.38 
 
 
490 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  24.2 
 
 
525 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  25 
 
 
437 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.314426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>