560 genes were found for organism Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rleg_5412  CDS  NC_012853  224  601  +  378  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  YP_002978790  normal  1  normal  0.162493  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5413  CDS  NC_012853  1073  1513  +  441  transcriptional regulator, MarR family  YP_002978791  normal  1  normal  0.173086  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5414  CDS  NC_012853  1602  2018  +  417  hypothetical protein  YP_002978792  normal  0.727525  normal  0.171952  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5415  CDS  NC_012853  2091  2402  -  312  hypothetical protein  YP_002978793  normal  0.788676  normal  0.119371  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5416  CDS  NC_012853  2424  2825  -  402  response regulator  YP_002978794  normal  1  normal  0.122104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5417  CDS  NC_012853  2915  3043  +  129  hypothetical protein  YP_002978795  normal  1  normal  0.113888  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5418  CDS  NC_012853  3277  3504  +  228  hypothetical protein  YP_002978796  normal  1  normal  0.117447  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5419  CDS  NC_012853  3523  4278  +  756  glutaredoxin  YP_002978797  normal  0.837061  normal  0.137324  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5420  CDS  NC_012853  4519  5007  -  489  putative signal peptide protein  YP_002978798  normal  1  normal  0.0854015  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5421  CDS  NC_012853  5523  5648  -  126  hypothetical protein  YP_002978799  normal  1  normal  0.102745  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5422  CDS  NC_012853  5870  7927  -  2058  histidine kinase  YP_002978800  normal  1  normal  0.0504919  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5423  CDS  NC_012853  8094  8444  +  351  hypothetical protein  YP_002978801  normal  0.372258  normal  0.0567866  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5424  CDS  NC_012853  8681  9055  -  375  hypothetical protein  YP_002978802  normal  0.657078  normal  0.0249254  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5425    NC_012853  9183  10319  +  1137      normal  1  normal  0.0210727  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5426  CDS  NC_012853  10715  11083  +  369  BA14K family protein  YP_002978803  normal  1  hitchhiker  0.00504216  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5427  CDS  NC_012853  11613  11870  -  258  protein of unknown function DUF982  YP_002978804  normal  1  hitchhiker  0.00455574  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5428  CDS  NC_012853  12116  13300  +  1185  hypothetical protein  YP_002978805  normal  1  hitchhiker  0.00235903  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5429  CDS  NC_012853  13502  13690  +  189  hypothetical protein  YP_002978806  normal  1  hitchhiker  0.00144015  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5430  CDS  NC_012853  13842  14183  -  342  hypothetical protein  YP_002978807  normal  1  hitchhiker  0.00174485  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5431  CDS  NC_012853  14180  14335  -  156  hypothetical protein  YP_002978808  normal  1  hitchhiker  0.00146185  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5432    NC_012853  14816  14959  -  144      normal  1  hitchhiker  0.00269011  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5433  CDS  NC_012853  15229  15360  -  132  hypothetical protein  YP_002978809  normal  1  hitchhiker  0.00145471  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5434    NC_012853  15832  16072  -  241      normal  1  decreased coverage  0.000759745  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5435    NC_012853  16102  16262  -  161      normal  1  decreased coverage  0.000740847  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5436  CDS  NC_012853  16322  17023  -  702  protein of unknown function DUF1223  YP_002978810  normal  1  decreased coverage  0.000960294  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5437  CDS  NC_012853  17227  17631  +  405  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  YP_002978811  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5438  CDS  NC_012853  17635  18354  +  720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  YP_002978812  normal  0.249555  hitchhiker  0.00388506  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5439  CDS  NC_012853  18737  19291  -  555  hypothetical protein  YP_002978813  normal  1  hitchhiker  0.00184625  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5440  CDS  NC_012853  19422  19829  -  408  hypothetical protein  YP_002978814  normal  0.983092  hitchhiker  0.0031733  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5441  CDS  NC_012853  20227  20355  +  129  hypothetical protein  YP_002978815  normal  0.977786  hitchhiker  0.00275391  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5442    NC_012853  20718  20866  -  149      normal  1  hitchhiker  0.00254605  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5443  CDS  NC_012853  20930  21424  +  495  hypothetical protein  YP_002978816  normal  0.50655  hitchhiker  0.00298896  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5444  CDS  NC_012853  21434  21547  -  114  hypothetical protein  YP_002978817  normal  0.248952  hitchhiker  0.00252234  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5445  CDS  NC_012853  21547  22542  -  996  hypothetical protein  YP_002978818  normal  0.147248  hitchhiker  0.00227167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5446  CDS  NC_012853  23257  24033  +  777  hypothetical protein  YP_002978819  normal  0.687644  hitchhiker  0.00592787  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5447  CDS  NC_012853  24030  25334  +  1305  hypothetical protein  YP_002978820  normal  0.0176116  hitchhiker  0.00709741  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5448  CDS  NC_012853  25337  26617  +  1281  hypothetical protein  YP_002978821  normal  0.0547483  normal  0.0192928  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5449  CDS  NC_012853  26614  27714  +  1101  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  YP_002978822  normal  0.0114113  normal  0.0272252  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5450  CDS  NC_012853  27720  29678  +  1959  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  YP_002978823  normal  0.530037  normal  0.170483  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5451  CDS  NC_012853  29692  30708  +  1017  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  YP_002978824  normal  0.648016  normal  0.239065  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5452    NC_012853  30791  30961  +  171      normal  0.755337  normal  0.333519  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5453  CDS  NC_012853  31613  33232  +  1620  Peptidase S53 propeptide  YP_002978825  normal  1  normal  0.552713  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5454  CDS  NC_012853  33294  34328  +  1035  hypothetical protein  YP_002978826  normal  1  normal  0.347496  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5455  CDS  NC_012853  34751  36406  +  1656  hypothetical protein  YP_002978827  normal  1  normal  0.899844  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5456  CDS  NC_012853  36393  37499  +  1107  hypothetical protein  YP_002978828  normal  0.324633  normal  0.925053  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5457  CDS  NC_012853  37524  39671  +  2148  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_002978829  normal  0.53699  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5458  CDS  NC_012853  39773  40030  +  258  hypothetical protein  YP_002978830  normal  0.0599305  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5459  CDS  NC_012853  40139  41743  +  1605  phospholipase D/Transphosphatidylase  YP_002978831  normal  0.146903  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5460  CDS  NC_012853  42028  43548  +  1521  hypothetical protein  YP_002978832  normal  0.0695349  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5461  CDS  NC_012853  43578  45887  +  2310  AAA ATPase  YP_002978833  normal  0.323053  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5462  CDS  NC_012853  45884  46891  +  1008  hypothetical protein  YP_002978834  normal  0.99145  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5463  CDS  NC_012853  47237  47623  +  387  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002978835  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5464    NC_012853  47620  47811  +  192      normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5465  CDS  NC_012853  47896  48795  -  900  hypothetical protein  YP_002978836  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5466  CDS  NC_012853  49367  49672  -  306  hypothetical protein  YP_002978837  normal  0.69686  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5467  CDS  NC_012853  50336  51472  -  1137  hypothetical protein  YP_002978838  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5468  CDS  NC_012853  51542  53461  -  1920  pathogenesis-related protein  YP_002978839  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5469  CDS  NC_012853  53458  55749  -  2292  hypothetical protein  YP_002978840  normal  0.913319  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5470  CDS  NC_012853  55975  57066  -  1092  protein of unknown function DUF1612  YP_002978841  normal  0.480823  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5471  CDS  NC_012853  57292  58440  +  1149  integrase family protein  YP_002978842  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5472    NC_012853  58493  58561  -  69      normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5473  CDS  NC_012853  58663  58959  +  297  hypothetical protein  YP_002978843  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5474    NC_012853  59147  59235  +  89      normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5475  CDS  NC_012853  59347  60522  +  1176  AAA ATPase  YP_002978844  normal  0.945567  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5476    NC_012853  60641  60774  -  134      normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5477  CDS  NC_012853  61047  62150  +  1104  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_002978845  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5478  CDS  NC_012853  63685  64878  -  1194  replication protein C  YP_002978846  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5479  CDS  NC_012853  65188  66216  -  1029  plasmid partitioning protein RepB  YP_002978847  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5480  CDS  NC_012853  66213  67430  -  1218  plasmid partitioning protein RepA  YP_002978848  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5481  CDS  NC_012853  67795  68421  +  627  putative autoinducer synthesis protein  YP_002978849  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5482  CDS  NC_012853  68435  69400  +  966  conjugal transfer protein TrbB  YP_002978850  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5483  CDS  NC_012853  69390  69770  +  381  Conjugal transfer protein TrbC  YP_002978851  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5484  CDS  NC_012853  69760  70059  +  300  conjugal transfer protein TrbD  YP_002978852  normal  0.43935  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5485  CDS  NC_012853  70069  72516  +  2448  conjugal transfer protein TrbE  YP_002978853  decreased coverage  0.00798845  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5486  CDS  NC_012853  72488  73288  +  801  conjugal transfer protein TrbJ  YP_002978854  normal  0.0871579  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5487  CDS  NC_012853  73285  73434  +  150  hypothetical protein  YP_002978855  normal  0.193532  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5488  CDS  NC_012853  73508  74656  +  1149  conjugal transfer protein TrbL  YP_002978856  normal  0.0710712  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5489  CDS  NC_012853  74676  75338  +  663  conjugal transfer protein TrbF  YP_002978857  normal  0.229718  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5490  CDS  NC_012853  75355  76176  +  822  conjugal transfer protein TrbG  YP_002978858  normal  0.26878  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5491  CDS  NC_012853  76179  76607  +  429  conjugal transfer protein TrbH  YP_002978859  normal  0.711174  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5492  CDS  NC_012853  76622  77902  +  1281  conjugal transfer protein TrbI  YP_002978860  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5493  CDS  NC_012853  77928  78638  -  711  transcriptional regulator, LuxR family  YP_002978861  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5494    NC_012853  78895  79065  +  171      normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5495  CDS  NC_012853  79546  80628  +  1083  hypothetical protein  YP_002978862  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5496  CDS  NC_012853  80625  81536  +  912  hypothetical protein  YP_002978863  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5497  CDS  NC_012853  82590  83249  -  660  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002978864  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5498  CDS  NC_012853  84081  84653  +  573  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002978865  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5499  CDS  NC_012853  84643  86037  +  1395  Amidohydrolase 3  YP_002978866  normal  0.544812  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5500  CDS  NC_012853  86174  87535  -  1362  MmgE/PrpD family protein  YP_002978867  normal  0.168199  normal  0.788577  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5501  CDS  NC_012853  87552  88616  -  1065  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  YP_002978868  normal  0.205355  normal  0.57704  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5502  CDS  NC_012853  88974  89837  -  864  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_002978869  normal  0.279255  normal  0.420367  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5503  CDS  NC_012853  89834  90487  -  654  demethylmenaquinone methyltransferase protein  YP_002978870  normal  0.196982  normal  0.409875  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5504  CDS  NC_012853  90531  91397  -  867  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  YP_002978871  normal  0.255533  normal  0.425831  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5505  CDS  NC_012853  91518  92606  -  1089  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  YP_002978872  normal  0.690258  normal  0.0976565  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5506  CDS  NC_012853  92603  93406  -  804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002978873  normal  0.673957  normal  0.0589597  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5507  CDS  NC_012853  93403  94302  -  900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002978874  normal  1  normal  0.0425652  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5508  CDS  NC_012853  94312  95355  -  1044  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002978875  normal  1  normal  0.0465771  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5509  CDS  NC_012853  95889  96521  +  633  protein of unknown function DUF433  YP_002978876  normal  1  normal  0.0404309  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5510  CDS  NC_012853  96638  96895  +  258  hypothetical protein  YP_002978877  normal  1  normal  0.0230147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5511  CDS  NC_012853  96911  97522  -  612  conjugal transfer protein TraH  YP_002978878  normal  1  normal  0.0167812  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>