45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5499 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5499  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 464 aa  932    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1879  amidohydrolase 3  36.65 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3045  hypothetical protein  32.51 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  34.12 
 
 		 1071 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  37.14 
 
 		 1066 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  30.43 
 
 		 1081 aa  50.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2688  phosphonate metabolism protein PhnM  33.68 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1069 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  32.35 
 
 		 1060 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  39.73 
 
 		 1138 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1067 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  35.29 
 
 		 1065 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  30.88 
 
 		 1062 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  28.99 
 
 		 1062 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  28.99 
 
 		 1062 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  28.99 
 
 		 1062 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  27.54 
 
 		 1049 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1239  phosphonate metabolism protein PhnM  31.73 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.788895  hitchhiker  0.000230339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2088  amidohydrolase-like  33.64 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  29.41 
 
 		 1062 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1093  phosphonate metabolism protein PhnM  30.77 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255627  hitchhiker  0.00301436 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  29.41 
 
 		 1062 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  33.93 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  27.94 
 
 		 1062 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  37.96 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0768  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  29.41 
 
 		 598 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2154  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.78 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0893  phosphonate metabolism protein PhnM  30.58 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  43.28 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  29.2 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0741  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  25.21 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3686  phosphonate metabolism protein PhnM  35.16 
 
 		 387 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  39.19 
 
 		 1111 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0725  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  25.21 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  37.93 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  35.58 
 
 		 1078 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  38.46 
 
 		 582 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  32.86 
 
 		 1062 aa  43.9  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2963  phosphonate metabolism protein PhnM  42.25 
 
 		 386 aa  43.9  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.513647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  35.71 
 
 		 593 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  41.56 
 
 		 447 aa  43.5  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0223  amidohydrolase 3  32.11 
 
 		 382 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4043  amidohydrolase 3  32.11 
 
 		 382 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1713  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  33.98 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>