More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5498 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5498  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 190 aa  383  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  33.73 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 230 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  33.13 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.13 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.73 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.94 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.37 
 
 		 265 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  34.94 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  34.29 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 272 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 231 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  34.34 
 
 		 235 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  33.73 
 
 		 234 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0124  two component transcriptional regulator  33.53 
 
 		 227 aa  98.2  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.352403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  33.13 
 
 		 233 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  33.13 
 
 		 233 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.13 
 
 		 237 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0485  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  32.54 
 
 		 227 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0173  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.33 
 
 		 227 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.505642  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0183  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.33 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  33.52 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  33.13 
 
 		 233 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  30.72 
 
 		 228 aa  95.1  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3116  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 229 aa  94.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202822  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2058  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  30.72 
 
 		 228 aa  94.4  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.275433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  33.73 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0766  two component transcriptional regulator  30.72 
 
 		 228 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0291358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  30.99 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  33.14 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  31.33 
 
 		 236 aa  90.5  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  30.49 
 
 		 243 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  31.33 
 
 		 228 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  32.92 
 
 		 252 aa  89.4  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  30.99 
 
 		 232 aa  87  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  32.53 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  31.49 
 
 		 229 aa  85.1  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  31.93 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.09 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.15 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.602411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  28.66 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  30.49 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0993  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.52 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  31.33 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2805  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.56 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  33.82 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2954  two component transcriptional regulator  37.25 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  32.12 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.65 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  29.65 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1659  two component transcriptional regulator  32.53 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  30.36 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  30.92 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  29.93 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2093  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.582679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1365  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  31.21 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  27.16 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.09 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  29.68 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0973  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3637  response regulator receiver  31.55 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.34 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0453  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.22 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  27.16 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  28.93 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  28.07 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.71 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  28.65 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  28.93 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  28.21 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  30.38 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  26.21 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  28.92 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.81 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0473  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  28.68 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.13 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1805  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1716  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  28.68 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00444869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  28.3 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  25.93 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  25.93 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  26.44 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  31.94 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  25.93 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  32.61 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>