4421 genes were found for organism Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 45    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
VSAL_I0001  CDS  NC_011312  312  746  435  flavodoxin  YP_002261563  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0002  CDS  NC_011312  811  2178  1368  tRNA modification GTPase TrmE  YP_002261564  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0003  CDS  NC_011312  2277  3902  1626  putative inner membrane protein translocase component YidC  YP_002261565  normal  0.0110357  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0004  CDS  NC_011312  4129  4482  354  ribonuclease P  YP_002261566  decreased coverage  0.00123584  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0005  CDS  NC_011312  4499  4633  135  50S ribosomal protein L34  YP_002261567  decreased coverage  0.000814875  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0006  CDS  NC_011312  4820  5557  738  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  YP_002261568  hitchhiker  0.00283619  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0007  CDS  NC_011312  5554  6225  672  putative amino-acid ABC transporter, permease protein  YP_002261569  hitchhiker  0.000426634  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0008  CDS  NC_011312  6380  7132  753  putative amino acid ABC transporter,substrate-binding protein  YP_002261570  hitchhiker  0.00216943  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0009  CDS  NC_011312  7427  8833  1407  chromosomal replication initiation protein  YP_002261571  decreased coverage  0.00184157  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0010  CDS  NC_011312  8866  9975  1110  DNA polymerase III subunit beta  YP_002261572  decreased coverage  0.000914164  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0011  CDS  NC_011312  9989  11068  1080  recombination protein F  YP_002261573  normal  0.10983  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0012  CDS  NC_011312  11086  13503  2418  DNA gyrase subunit B  YP_002261574  normal  0.100397  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0013  misc_feature  NC_011312  13734  16223  2490      normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0014  CDS  NC_011312  14049  15239  1191  transposase  YP_002261575  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0015  CDS  NC_011312  16295  16642  348  transposase  YP_002261576  normal  0.461539  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0016  CDS  NC_011312  16639  16953  315  transposase  YP_002261577  normal  0.715954  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0017  CDS  NC_011312  17172  18809  1638  chaperonin GroEL  YP_002261578  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0018  CDS  NC_011312  18902  19189  288  10 kDa chaperonin 1  YP_002261579  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0019  CDS  NC_011312  19716  20909  1194  transposase  YP_002261580  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0020  CDS  NC_011312  21269  21523  255  hypothetical protein  YP_002261581  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0021  CDS  NC_011312  22530  23489  960  antirestriction protein  YP_002261582  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0022  CDS  NC_011312  23916  25109  1194  transposase  YP_002261583  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0023  CDS  NC_011312  25189  26034  846  metallo-beta-lactamase superfamily protein  YP_002261584  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0024  CDS  NC_011312  26437  26988  552  adenylate cyclase  YP_002261585  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0025  CDS  NC_011312  27382  27747  366  hypothetical protein  YP_002261586  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0026  CDS  NC_011312  27776  28180  405  hypothetical protein  YP_002261587  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0027  CDS  NC_011312  28436  29215  780  hypothetical protein  YP_002261588  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0028  CDS  NC_011312  29602  30555  954  hypothetical protein  YP_002261589  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0029  CDS  NC_011312  30807  31769  963  transposase  YP_002261590  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0030  CDS  NC_011312  32166  32456  291  hypothetical protein  YP_002261591  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0031  CDS  NC_011312  33193  35412  2220  putative cell wall degradation enzyme  YP_002261592  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0032  CDS  NC_011312  35412  35801  390  hypothetical protein  YP_002261593  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0033  CDS  NC_011312  35944  36303  360  hypothetical protein  YP_002261594  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0034  CDS  NC_011312  36382  37035  654  hypothetical protein  YP_002261595  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0035  CDS  NC_011312  37276  38466  1191  transposase  YP_002261596  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0036  misc_feature  NC_011312  38547  39242  696      normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0037  misc_feature  NC_011312  39505  40020  516      normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0038  CDS  NC_011312  40119  41000  882  transposase  YP_002261597  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0039  CDS  NC_011312  41289  42239  951  transposase  YP_002261598  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0040  CDS  NC_011312  42740  43933  1194  transposase  YP_002261599  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0041  misc_feature  NC_011312  44102  44461  360      normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0042  CDS  NC_011312  44867  46393  1527  putative competence protein  YP_002261600  normal  0.744278  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0043  CDS  NC_011312  46481  47350  870  putative acyltransferase  YP_002261601  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0044  CDS  NC_011312  47417  48040  624  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  YP_002261602  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0045  CDS  NC_011312  48066  49049  984  serine/threonine protein kinase  YP_002261603  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0046  CDS  NC_011312  49108  50526  1419  putative ferredoxin  YP_002261604  normal  0.65936  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0047  CDS  NC_011312  50752  51015  264  hypothetical protein  YP_002261605  normal  0.15035  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0048  CDS  NC_011312  51533  52318  786  putative sporulation-control protein  YP_002261606  normal  0.0812821  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0049  CDS  NC_011312  52420  53067  648  hemolysin III  YP_002261607  normal  0.152142  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0050  CDS  NC_011312  53364  54557  1194  transposase  YP_002261608  normal  0.677312  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0051  CDS  NC_011312  54711  54920  210  cold shock protein  YP_002261609  normal  0.86437  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0052  CDS  NC_011312  55198  56730  1533  threonine dehydratase  YP_002261610  normal  0.954999  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0053  CDS  NC_011312  56735  58207  1473  dihydroxy-acid dehydratase  YP_002261611  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0054  CDS  NC_011312  58234  58482  249  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  YP_002261612  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0055  misc_feature  NC_011312  58486  59766  1281      normal  0.752795  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0056  CDS  NC_011312  59847  61040  1194  transposase  YP_002261613  normal  0.713246  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0057  CDS  NC_011312  61632  62159  528  hypothetical protein  YP_002261614  normal  0.088057  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0058  CDS  NC_011312  62442  63239  798  putative ParA chromosome partitioning protein  YP_002261615  normal  0.131132  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0059  CDS  NC_011312  63236  64210  975  putative chromosome partitioning protein ParB  YP_002261616  normal  0.526616  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0060  CDS  NC_011312  64200  64604  405  hypothetical protein  YP_002261617  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0061  CDS  NC_011312  64789  65160  372  hypothetical protein  YP_002261618  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0062  CDS  NC_011312  65851  66444  594  hypothetical protein  YP_002261619  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0063  misc_feature  NC_011312  67138  68629  1492      normal  0.512976  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0064  misc_feature  NC_011312  68814  69041  228      normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0065  CDS  NC_011312  69062  69418  357  transposase  YP_002261620  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0066  CDS  NC_011312  69494  69790  297  transposase  YP_002261621  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0067  misc_feature  NC_011312  69805  71031  1227      normal  0.350696  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0068  misc_feature  NC_011312  71155  72644  1490      normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0069  CDS  NC_011312  72716  73063  348  transposase  YP_002261622  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0070  CDS  NC_011312  73060  73374  315  transposase  YP_002261623  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0071  misc_feature  NC_011312  73457  74899  1443      normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0072  CDS  NC_011312  74902  76278  1377  potassium transporter peripheral membrane component  YP_002261624  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0073  CDS  NC_011312  76303  77637  1335  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  YP_002261625  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0074  CDS  NC_011312  77686  78651  966  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_002261626  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0075  CDS  NC_011312  78654  79163  510  peptide deformylase  YP_002261627  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0076  CDS  NC_011312  79281  80342  1062  putative cell wall degradation enzyme  YP_002261628  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0077  CDS  NC_011312  80351  81460  1110  Smf protein  YP_002261629  normal  0.64141  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0078  CDS  NC_011312  81463  81936  474  hypothetical protein  YP_002261630  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0079  CDS  NC_011312  81946  82515  570  DNA topoisomerase  YP_002261631  normal  0.870328  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0080  CDS  NC_011312  82555  83673  1119  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  YP_002261632  hitchhiker  0.00483386  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0081  CDS  NC_011312  83673  84209  537  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase catalytic subunit  YP_002261633  normal  0.433524  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0082  CDS  NC_011312  84360  84917  558  hypothetical protein  YP_002261634  normal  0.687702  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0083  CDS  NC_011312  84984  85805  822  shikimate 5-dehydrogenase  YP_002261635  normal  0.59928  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0084  CDS  NC_011312  85879  86064  186  hypothetical protein  YP_002261636  normal  0.170525  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0085  CDS  NC_011312  86057  86602  546  putative transferase  YP_002261637  unclonable  3.67586e-05  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0086  CDS  NC_011312  114812  115696  885  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  YP_002261638  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0087  CDS  NC_011312  115825  117309  1485  ketol-acid reductoisomerase  YP_002261639  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0088  CDS  NC_011312  117397  117648  252  hypothetical protein  YP_002261640  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0089  CDS  NC_011312  117758  120826  3069  putative integral membrane component of multidrug efflux system  YP_002261641  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0090  CDS  NC_011312  120838  121944  1107  putative multidrug transporter, HlyD family  YP_002261642  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0091  CDS  NC_011312  121963  122562  600  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  YP_002261643  normal  0.903201  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0092  CDS  NC_011312  122717  124732  2016  ATP-dependent DNA helicase rep  YP_002261644  normal  0.157816  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0093  CDS  NC_011312  124833  125240  408  cytochrome c  YP_002261645  normal  0.0144946  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0094  misc_feature  NC_011312  126692  128423  1732      normal  0.0143123  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0095  CDS  NC_011312  128498  130051  1554  transport protein, extracellular solute-binding protein  YP_002261646  normal  0.0865281  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0096  CDS  NC_011312  130188  131165  978  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  YP_002261647  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0097  CDS  NC_011312  131168  132109  942  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  YP_002261648  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0098  CDS  NC_011312  132347  133927  1581  transporter, BCCT family  YP_002261649  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0099  CDS  NC_011312  134012  134728  717  DNA polymerase III subunit epsilon  YP_002261650  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_I0100  CDS  NC_011312  134738  136618  1881  putative cyclic nucleotide binding protein  YP_002261651  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 45    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>