51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0048 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  100 
 
 
261 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  60.75 
 
 
280 aa  345  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  59.02 
 
 
268 aa  332  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  58.27 
 
 
268 aa  332  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  37.05 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  38.1 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  38.1 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  38.1 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  38.1 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  35.47 
 
 
254 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  36.17 
 
 
251 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  37.66 
 
 
251 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  36.17 
 
 
251 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  37.04 
 
 
241 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  36.4 
 
 
251 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  29.82 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  34.65 
 
 
250 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  33.19 
 
 
246 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  30.52 
 
 
246 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  31 
 
 
246 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  33.05 
 
 
259 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  30.57 
 
 
246 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  30.57 
 
 
246 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  30.12 
 
 
259 aa  99  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  29.32 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  33.17 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  31.09 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  30.26 
 
 
247 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  30.91 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  30.66 
 
 
318 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  27.68 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  27.43 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  28.02 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  31.9 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  25.56 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  23.35 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  27.6 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  26.09 
 
 
323 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  28.57 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  26.75 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  26.3 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  24.18 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  26.99 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  23.21 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  24.79 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2341  sporulation-control protein Spo0M, putative  37.89 
 
 
106 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  26.13 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  23.98 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  25.78 
 
 
397 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  27.46 
 
 
132 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  25 
 
 
133 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>