52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1070 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  100 
 
 
327 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  62.69 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  39 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  43.08 
 
 
132 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  44.62 
 
 
133 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  31.91 
 
 
259 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  30.88 
 
 
251 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  30.88 
 
 
251 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  29.95 
 
 
251 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  29.95 
 
 
251 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  29.49 
 
 
251 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  29.49 
 
 
251 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  29.36 
 
 
252 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  29.36 
 
 
252 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  32.78 
 
 
241 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  31.96 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  32.22 
 
 
280 aa  96.7  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  29.49 
 
 
251 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  30.77 
 
 
261 aa  96.3  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  34.26 
 
 
254 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  30.23 
 
 
259 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 
268 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  29.58 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  27 
 
 
316 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  30.7 
 
 
259 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  29.41 
 
 
246 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  29.49 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  29.73 
 
 
262 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  32.09 
 
 
246 aa  86.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  28.52 
 
 
254 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  29.22 
 
 
317 aa  86.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  27.02 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  29.49 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  30.28 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  34.42 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  29.86 
 
 
246 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  29.86 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  28.31 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  29.41 
 
 
246 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  25.71 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  29.22 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  26.78 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  31.75 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  27.95 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  30.26 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  26.27 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  27.78 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  30.72 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  27.83 
 
 
250 aa  62.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  24.06 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  26.52 
 
 
254 aa  50.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  23.21 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>