52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1506 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  100 
 
 
318 aa  611  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  46.75 
 
 
324 aa  255  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  45.91 
 
 
376 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  39.56 
 
 
316 aa  195  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  40.86 
 
 
317 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  41.43 
 
 
330 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  39.84 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  40.8 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  40.71 
 
 
323 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  41.54 
 
 
261 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  36.92 
 
 
397 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  36.4 
 
 
262 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  37.55 
 
 
259 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  34.87 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  35.56 
 
 
257 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  34.65 
 
 
312 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  34.48 
 
 
259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  35.46 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  32.7 
 
 
261 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  43.4 
 
 
256 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  33.2 
 
 
254 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  34.1 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  29.78 
 
 
254 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  31.27 
 
 
270 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  29.15 
 
 
254 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  28.89 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  27.35 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  24.9 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  27.35 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  27.35 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  30.72 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  28.22 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  27.41 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  28.27 
 
 
241 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  28.86 
 
 
251 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  26.87 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  26.87 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  27.23 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  28 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  26 
 
 
251 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  26.5 
 
 
251 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  26.5 
 
 
251 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  26.27 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  23.02 
 
 
132 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  25.12 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  25 
 
 
247 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  26.5 
 
 
268 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 
268 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  24.86 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  25.18 
 
 
133 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  24.39 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0764  hypothetical protein  30.47 
 
 
228 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>