53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1761 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  100 
 
 
248 aa  510  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  63.41 
 
 
247 aa  321  9.000000000000001e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  60.98 
 
 
247 aa  305  6e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  43.37 
 
 
246 aa  207  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  43.37 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  44.98 
 
 
246 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  44.98 
 
 
246 aa  198  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  44.98 
 
 
246 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  34.75 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  35.04 
 
 
261 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  36.29 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  32.05 
 
 
259 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  29.28 
 
 
259 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  37.2 
 
 
251 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  37.8 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  37.2 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  37.2 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  36.97 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  36.97 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  36.59 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  33.05 
 
 
323 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  28.57 
 
 
262 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  29.48 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  31.65 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  35.98 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  35.37 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  35.02 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  34.02 
 
 
254 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  32.42 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  30.71 
 
 
261 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  31.91 
 
 
280 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  32.24 
 
 
256 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  30.8 
 
 
376 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  29.76 
 
 
241 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  31.73 
 
 
316 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  35.06 
 
 
268 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  29.96 
 
 
330 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  30.6 
 
 
397 aa  95.9  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  32.88 
 
 
317 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  29.25 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  30.43 
 
 
254 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  30.91 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  28.81 
 
 
324 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  30.14 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  31.46 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  28.38 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  30.26 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  29.29 
 
 
132 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  27.66 
 
 
133 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  24.64 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  24.64 
 
 
312 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  24.86 
 
 
318 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>