52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2480 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  100 
 
 		 280 aa  578  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  71.37 
 
 		 268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  69.47 
 
 		 268 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  60.75 
 
 		 261 aa  345  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  36.86 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  38.55 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  35.29 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  34.26 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  35.29 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  35.29 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  35.29 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  35.29 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  32.93 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  33.33 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  34.6 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  34.78 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  35.65 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  33.06 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  31.86 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  33.06 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  32.65 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  31.91 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  27.63 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  33.63 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  28.15 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  32.22 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  28.63 
 
 		 259 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  27.78 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  29.63 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  28.03 
 
 		 321 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  29.41 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  28.44 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  26.01 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  29.44 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  29.65 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  27.11 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  29.33 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  27.92 
 
 		 323 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  29.6 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  26.32 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  27.95 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  27.11 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  25.22 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  26.16 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  28.02 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  26.11 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  23.32 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  24.89 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  25.69 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  25.52 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  25.96 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2341  sporulation-control protein Spo0M, putative  34.74 
 
 		 106 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>