52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4403 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  56.69 
 
 
254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  56.42 
 
 
257 aa  284  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  55.47 
 
 
270 aa  275  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  44.4 
 
 
330 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  42.15 
 
 
262 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  44.73 
 
 
316 aa  204  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  50.23 
 
 
335 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  44.3 
 
 
317 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  41.31 
 
 
259 aa  201  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  42.91 
 
 
261 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  40.93 
 
 
259 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  42.64 
 
 
376 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  45.11 
 
 
397 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  42.75 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  40.54 
 
 
259 aa  195  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  47.53 
 
 
323 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  38.93 
 
 
324 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  38.67 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  42.02 
 
 
259 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  32.49 
 
 
247 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  31.8 
 
 
247 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  35.78 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  32.51 
 
 
312 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  35 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  31.75 
 
 
248 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  31.84 
 
 
254 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  30.96 
 
 
246 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  30.96 
 
 
246 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  30.96 
 
 
246 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  30.99 
 
 
254 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  28.69 
 
 
246 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  28.24 
 
 
246 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  32.59 
 
 
251 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  32.14 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  32.14 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  32.14 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  31.84 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  32.14 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  29.39 
 
 
250 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  32 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  32 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  31.7 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  27.71 
 
 
321 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  27.98 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  26.01 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  23.32 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  23.53 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  25.11 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  24.42 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  26.57 
 
 
132 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>