54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4556 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  100 
 
 
330 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  65.04 
 
 
323 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  57.44 
 
 
397 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  58.28 
 
 
335 aa  326  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  50.91 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  57.65 
 
 
376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  50.3 
 
 
317 aa  301  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  53.05 
 
 
262 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  57.14 
 
 
261 aa  285  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  56.64 
 
 
256 aa  278  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  47.73 
 
 
324 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  50 
 
 
261 aa  245  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  44.73 
 
 
257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  42.97 
 
 
259 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  43.63 
 
 
259 aa  202  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  47.69 
 
 
256 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  42.47 
 
 
259 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  44.98 
 
 
259 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  40.7 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  41.43 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  42.13 
 
 
270 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  36.69 
 
 
305 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  33.6 
 
 
312 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  31.78 
 
 
247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  32.74 
 
 
247 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  31.9 
 
 
254 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  29.67 
 
 
251 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  28.86 
 
 
251 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  29.27 
 
 
251 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  29.27 
 
 
251 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  27.86 
 
 
254 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  30.59 
 
 
246 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  29.84 
 
 
251 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  29.15 
 
 
252 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  29.03 
 
 
246 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  28.11 
 
 
246 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  29.15 
 
 
252 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  29.49 
 
 
246 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  29.03 
 
 
246 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  28.86 
 
 
251 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  28.86 
 
 
251 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  29.96 
 
 
248 aa  96.3  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  27.31 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  28.68 
 
 
241 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  28.89 
 
 
250 aa  93.6  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  26.77 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  29.33 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  28.76 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  27.84 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  28.57 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0764  hypothetical protein  37.66 
 
 
228 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  24.11 
 
 
132 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  25.52 
 
 
133 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>