49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3245 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  100 
 
 
250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  44.17 
 
 
246 aa  193  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  44.07 
 
 
246 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  44.07 
 
 
246 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  43.64 
 
 
246 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  42.55 
 
 
246 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  37.13 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  37.02 
 
 
247 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  36.29 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  34.65 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  37.05 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  33.91 
 
 
268 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  33.63 
 
 
280 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  33.19 
 
 
268 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  33.33 
 
 
241 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  29.86 
 
 
262 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  28.33 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  32.29 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  29.52 
 
 
335 aa  95.1  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  30.96 
 
 
261 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  28.89 
 
 
330 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  30.45 
 
 
259 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  30.91 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  31.11 
 
 
251 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  31.95 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  30.67 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  30.7 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  30.22 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  28.64 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  29.78 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  29.78 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  29.33 
 
 
324 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  29.78 
 
 
251 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  29.78 
 
 
252 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  29.78 
 
 
252 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  29.39 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  28.33 
 
 
323 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  34.55 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  29.33 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  26.01 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  28.76 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  26.24 
 
 
316 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  26.24 
 
 
317 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  27.09 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  30.21 
 
 
318 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  26.89 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  25 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  27.95 
 
 
327 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  22.17 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>