53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00398 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  100 
 
 
268 aa  555  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  92.13 
 
 
268 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  69.47 
 
 
280 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  58.27 
 
 
261 aa  332  5e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  37.93 
 
 
254 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  38.37 
 
 
241 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  35.34 
 
 
251 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  35.34 
 
 
251 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  35.34 
 
 
251 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  35.34 
 
 
252 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  35.34 
 
 
252 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  34.91 
 
 
251 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  34.48 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  34.91 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  35.17 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  32.58 
 
 
246 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  27.95 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  31.6 
 
 
246 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  33.91 
 
 
250 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  30.68 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  33.63 
 
 
259 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  35.06 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  28.47 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  31.3 
 
 
246 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  31.3 
 
 
246 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  31.3 
 
 
246 aa  95.5  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  28.81 
 
 
259 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  29.74 
 
 
259 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  29.58 
 
 
327 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  30.67 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  34.67 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  27.56 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  30.22 
 
 
376 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  28.45 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  26.99 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  30.9 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  27.27 
 
 
330 aa  82  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  29.44 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  26.85 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  28.26 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  27.11 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  29.33 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  27.56 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  26.46 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  25.11 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  25.78 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  28 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  26.27 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  25.69 
 
 
132 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  27.08 
 
 
133 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2341  sporulation-control protein Spo0M, putative  38.67 
 
 
106 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  26.5 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  25 
 
 
305 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>