53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2836 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  99.59 
 
 
246 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  98.37 
 
 
246 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  80.82 
 
 
246 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  68.78 
 
 
246 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  44.98 
 
 
248 aa  198  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  43.93 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  43.1 
 
 
247 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  44.07 
 
 
250 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  34.6 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  36.04 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  36.04 
 
 
251 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  36.04 
 
 
251 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  36.04 
 
 
251 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  37.1 
 
 
254 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  35.87 
 
 
252 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  35.87 
 
 
252 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  33.33 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  35.14 
 
 
251 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  31.51 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  31.94 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  34.23 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  33.78 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  34.09 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  31.44 
 
 
323 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  31.48 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  33.06 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  32.87 
 
 
241 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  31.67 
 
 
259 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  31.22 
 
 
324 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  30.88 
 
 
256 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  29.75 
 
 
376 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  32.11 
 
 
268 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  28.63 
 
 
257 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  29.03 
 
 
330 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  30.57 
 
 
261 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  30.88 
 
 
256 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  29.73 
 
 
397 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  28.57 
 
 
317 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  28.57 
 
 
316 aa  96.3  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  31.3 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  27.35 
 
 
335 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  33.33 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  29.63 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  27.73 
 
 
270 aa  85.1  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  25.9 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  29.86 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  30.89 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  27.35 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  28.06 
 
 
132 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  30.94 
 
 
133 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  27.35 
 
 
305 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  26.52 
 
 
312 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>