63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0024 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  100 
 
 
183 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  69.89 
 
 
185 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  67.98 
 
 
183 aa  262  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  65.56 
 
 
185 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  61.93 
 
 
194 aa  243  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1784  putative adenylyl cyclase CyaB  63.28 
 
 
194 aa  243  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02204  hypothetical protein  62.15 
 
 
182 aa  234  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  63.07 
 
 
195 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  65.32 
 
 
197 aa  234  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  63.07 
 
 
195 aa  233  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  63.07 
 
 
195 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  63.07 
 
 
195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  61.93 
 
 
204 aa  217  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  61.93 
 
 
204 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  61.93 
 
 
213 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  52.78 
 
 
193 aa  208  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  51.14 
 
 
179 aa  183  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  51.14 
 
 
179 aa  183  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  44.89 
 
 
180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2924  adenylyl cyclase CyaB  44.89 
 
 
180 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  44.32 
 
 
179 aa  157  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2502  adenylyl cyclase CyaB  43.75 
 
 
179 aa  150  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  30.34 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  26.7 
 
 
177 aa  62  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  26.74 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  23.84 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  23.89 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  26.71 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  23.49 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  25.99 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  27.67 
 
 
176 aa  52  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  25.42 
 
 
187 aa  51.6  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0808  putative adenylyl cyclase CyaB  28.04 
 
 
193 aa  51.2  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0530  putative adenylyl cyclase CyaB  24.86 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  25.17 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  23.08 
 
 
181 aa  47.8  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3053  adenylate cyclase  27.18 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0006  adenylate cyclase  29.29 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.136902 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  25.61 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  24.32 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3335  adenylate cyclase  27.17 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3048  adenylate cyclase  25.73 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.128686  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  23.5 
 
 
177 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  26.25 
 
 
176 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  23.5 
 
 
177 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  23.93 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  23.93 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0204  adenylate cyclase  26.09 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2929  adenylate cyclase, putative  26.09 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1229  adenylyl cyclase CyaB  27.87 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3999  adenylate cyclase  26.09 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3381  putative adenylate cyclase  26.09 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1614  putative adenylate cyclase  26.09 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2988  putative adenylate cyclase  26.09 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4073  adenylate cyclase  26.09 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0098  adenylate cyclase  23.03 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  21.51 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3261  adenylate cyclase  28.42 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0080  adenylate cyclase  22.7 
 
 
177 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678459  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  25.68 
 
 
172 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0013  putative adenylate cyclase  20.35 
 
 
178 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0232  adenylyl cyclase CyaB  23.81 
 
 
178 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3919  adenylate cyclase  20.35 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>