494 genes were found for organism Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CNF00010  CDS  NC_006691  580  2135  1556  conserved hypothetical protein  XP_571271  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00020  CDS  NC_006691  3140  5110  1971  maltose porter, putative  XP_571466  normal  0.0123203  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00030    NC_006691  6043  7409  1367      normal  0.132685  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00040  CDS  NC_006691  7613  8297  685  mitochondrion protein, putative  XP_571273  normal  0.0979015  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00050  CDS  NC_006691  10790  12347  1558  phosphoglycerate dehydrogenase, putative  XP_571275  normal  0.33457  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00060  tRNA  NC_006691  12677  12772  96  tRNA-Glu    normal  0.110338  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00070  CDS  NC_006691  13071  15844  2774  glutamate-tRNA ligase, putative  XP_571277  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00080  CDS  NC_006691  16426  23916  7491  membrane protein, putative  XP_571463  normal  0.280559  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00090  CDS  NC_006691  24204  26241  2038  rRNA modification-related protein, putative  XP_571279  normal  0.0365741  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00100  CDS  NC_006691  26337  30166  3830  3' tRNA processing endoribonuclease, putative  XP_571461  normal  0.0118695  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00110  tRNA  NC_006691  33888  33985  98  tRNA-Glu    normal  0.0104467  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00120  CDS  NC_006691  34262  37048  2787  conserved hypothetical protein  XP_571282  normal  0.587675  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00130  CDS  NC_006691  39223  41567  2345  expressed protein  XP_571464  normal  0.479636  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00140  CDS  NC_006691  41651  44989  3339  conserved hypothetical protein  XP_571284  normal  0.505175  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00150  CDS  NC_006691  45312  46390  1079  mitochondrion protein, putative  XP_571658  hitchhiker  0.00275646  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00160  CDS  NC_006691  46554  47302  749  Rho small monomeric GTPase, putative  XP_571459  hitchhiker  0.00283225  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00170  CDS  NC_006691  52871  54847  1977  expressed protein  XP_571286  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00180  CDS  NC_006691  56386  57594  1209  conserved hypothetical protein  XP_571288  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00190  CDS  NC_006691  57661  60186  2526  hypothetical protein  XP_571457  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00200  CDS  NC_006691  64673  66206  1534  expressed protein  XP_571447  normal  0.307762  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00210  CDS  NC_006691  66800  67821  1022  hypothetical protein  XP_571290  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00220  CDS  NC_006691  67790  69274  1485  expressed protein  XP_571292  normal  0.456156  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00230  CDS  NC_006691  69773  75460  5688  conserved hypothetical protein  XP_571294  normal  0.927133  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00240  CDS  NC_006691  79924  81365  1442  expressed protein  XP_571295  decreased coverage  0.00356988  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00250  CDS  NC_006691  81710  84104  2395  expressed protein  XP_571509  normal  0.14327  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00260  CDS  NC_006691  85341  88434  3094  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  XP_571449  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00270  CDS  NC_006691  88724  90732  2009  hypothetical protein  XP_571451  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00280  CDS  NC_006691  90808  93406  2599  hypothetical protein  XP_571455  normal  0.234559  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00290  CDS  NC_006691  95743  99266  3524  nucleoside-diphosphatase, putative  XP_571453  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00300  CDS  NC_006691  99304  104321  5018  hypothetical protein  XP_571661  normal  0.133228  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00310  CDS  NC_006691  107062  109414  2353  high-affinity methionine permease, putative  XP_571467  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00320  CDS  NC_006691  109676  111546  1871  nicotinate-nucleotide adenylyltransferase, putative  XP_571297  normal  0.0610817  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00330  CDS  NC_006691  112687  115710  3024  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  XP_571301  normal  0.0814592  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00340  CDS  NC_006691  116135  120622  4488  conserved hypothetical protein  XP_571480  normal  0.0141918  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00350  CDS  NC_006691  122079  124488  2410  conserved hypothetical protein  XP_571303  normal  0.157268  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00360  CDS  NC_006691  125254  126905  1652  conserved hypothetical protein  XP_571713  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00370  CDS  NC_006691  132949  136217  3269  conserved hypothetical protein  XP_571479  normal  0.0970801  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00380  CDS  NC_006691  140292  140616  325  hypothetical protein  XP_571663  normal  0.564132  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00390  CDS  NC_006691  144721  149952  5232  DNA-directed RNA polymerase iii largest subunit, putative  XP_571468  normal  0.297029  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00400  CDS  NC_006691  150060  151254  1195  UMP-CMP kinase, putative  XP_571305  normal  0.0347693  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00410  CDS  NC_006691  151675  152918  1244  hypothetical protein  XP_571307  normal  0.482719  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00420  CDS  NC_006691  153621  156191  2571  SLY1 protein, putative  XP_571469  normal  0.255006  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00430  CDS  NC_006691  156219  157872  1654  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  XP_571478  normal  0.15577  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00440  CDS  NC_006691  158075  160653  2579  basic amino acid transporter, putative  XP_571477  normal  0.685855  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00450  CDS  NC_006691  160785  164430  3646  hypothetical protein  XP_571309  normal  0.0334674  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00460  CDS  NC_006691  165535  167889  2355  alpha-glucoside transport-related protein, putative  XP_571470  normal  0.0199479  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00470  CDS  NC_006691  168487  169387  901  hypothetical protein  XP_571476  decreased coverage  0.000959419  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00480  CDS  NC_006691  169821  171151  1331  hypothetical protein  XP_571475  normal  0.110618  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00490  CDS  NC_006691  171471  172733  1263  conserved hypothetical protein  XP_571474  normal  0.0288931  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00500  CDS  NC_006691  172883  175303  2421  septin ring protein, putative  XP_571311  normal  0.0927358  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00510  CDS  NC_006691  176165  177253  1089  conserved hypothetical protein  XP_571665  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00520  CDS  NC_006691  178425  180630  2206  hypothetical protein  XP_571233  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00530  CDS  NC_006691  182777  183494  718  hypothetical protein  XP_571667  normal  0.862533  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00540  CDS  NC_006691  183811  186358  2548  diacylglycerol O-acyltransferase, putative  XP_571235  normal  0.213823  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00550  CDS  NC_006691  186801  187775  975  tRNA specific adenosine deaminase, putative  XP_571237  decreased coverage  0.00012286  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00560  CDS  NC_006691  189079  191894  2816  expressed protein  XP_571473  normal  0.127311  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00570  CDS  NC_006691  192650  194852  2203  conserved hypothetical protein  XP_571472  normal  0.0429252  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00580  CDS  NC_006691  195044  195690  647  hypothetical protein  XP_571238  normal  0.0733658  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00590  CDS  NC_006691  197504  199972  2469  hypothetical protein  XP_571471  normal  0.301862  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00600  CDS  NC_006691  200116  202631  2516  trehalose transport-related protein, putative  XP_571538  normal  0.633366  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00610  CDS  NC_006691  203607  206217  2611  alpha-glucosidase, putative  XP_571239  normal  0.260556  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00620  CDS  NC_006691  206401  209930  3530  expressed protein  XP_571240  normal  0.170983  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00630  CDS  NC_006691  210217  211696  1480  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  XP_571714  normal  0.0899568  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00640  CDS  NC_006691  212066  215261  3196  hypothetical protein  XP_571536  normal  0.258141  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00650  CDS  NC_006691  216065  220767  4703  pyruvate carboxylase, putative  XP_571482  normal  0.242761  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00660  CDS  NC_006691  222497  225356  2860  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  XP_571484  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00670  CDS  NC_006691  225321  226095  775  structural constituent of ribosome, putative  XP_571241  normal  0.39165  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00680  CDS  NC_006691  226352  228504  2153  conserved hypothetical protein  XP_571486  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00690  CDS  NC_006691  227955  228489  535  hypothetical protein  XP_571242  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00700  tRNA  NC_006691  232020  232120  101  tRNA-Leu    normal  0.609242  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00710  CDS  NC_006691  232288  233114  827  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  XP_571243  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00720  CDS  NC_006691  232821  234701  1881  conserved hypothetical protein  XP_571534  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00730  CDS  NC_006691  234859  237390  2532  glycine-tRNA ligase, putative  XP_571244  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00740  CDS  NC_006691  237925  239330  1406  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  XP_571245  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00750  CDS  NC_006691  239628  240641  1014  conserved hypothetical protein  XP_571246  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00760  CDS  NC_006691  240675  241450  776  expressed protein  XP_571669  normal  0.886842  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00770  CDS  NC_006691  241617  244144  2528  conserved hypothetical protein  XP_571488  normal  0.660788  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00780  CDS  NC_006691  244341  249701  5361  cleavage and polyadenylation specific protein, putative  XP_571490  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00790  CDS  NC_006691  249871  265172  15302  motor, putative  XP_571532  normal  0.953235  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00800  CDS  NC_006691  265309  266896  1588  hypothetical protein  XP_571530  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00810  CDS  NC_006691  267163  268551  1389  conserved hypothetical protein  XP_571493  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00820  CDS  NC_006691  268801  270790  1990  expressed protein  XP_571247  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00830  CDS  NC_006691  272393  274872  2480  conserved hypothetical protein  XP_571248  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00840  tRNA  NC_006691  275540  275639  100  tRNA-Arg    normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00850  CDS  NC_006691  275909  276727  819  hypothetical protein  XP_571249  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00860  CDS  NC_006691  276721  278087  1367  pre-mRNA splicing factor, putative  XP_571511  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00870  CDS  NC_006691  278311  279317  1007  conserved hypothetical protein  XP_571495  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00880  CDS  NC_006691  279763  282083  2321  hypothetical protein  XP_571497  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00890  CDS  NC_006691  283217  287285  4069  importin beta-4 subunit, putative  XP_571503  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00900  CDS  NC_006691  287535  290292  2758  hypothetical protein  XP_571250  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00910  CDS  NC_006691  290432  293142  2711  glycosyl transferase, putative  XP_571251  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00920  CDS  NC_006691  293280  295853  2574  mannosyltransferase, putative  XP_571671  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00930  CDS  NC_006691  295996  296696  701  hypothetical protein  XP_571252  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00940  CDS  NC_006691  297756  299355  1600  structural constituent of cytoskeleton, putative  XP_571575  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00950  CDS  NC_006691  299613  300942  1330  transcription/repair factor TFIIH subunit Tfb3, putative  XP_571505  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00960  CDS  NC_006691  301252  301779  528  hypothetical protein  XP_571673  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00970  CDS  NC_006691  302011  302918  908  cytochrome c heme lyase (cchl), putative  XP_571507  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00980  CDS  NC_006691  303100  305558  2459  expressed protein  XP_571573  normal  0.587675  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF00990  CDS  NC_006691  307311  309215  1905  hypothetical protein  XP_571540  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNF01000  CDS  NC_006691  309430  311877  2448  endopeptidase, putative  XP_571542  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>