14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00420 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF00420  SLY1 protein, putative  100 
 
 		 764 aa  1547    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02518  Golgi transport protein Sly1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14320)  43.73 
 
 		 527 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00923388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40796  predicted protein  35.07 
 
 		 641 aa  372  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52201  Vesicle trafficking protein Sly1 (Sec1 family)  34.85 
 
 		 645 aa  362  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0194128  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43202  predicted protein  30.65 
 
 		 648 aa  265  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.197482  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51437  predicted protein  22.54 
 
 		 620 aa  97.4  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0608965  hitchhiker  0.00430035 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11956  predicted protein  23.12 
 
 		 588 aa  97.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01300  VpsB, putative  22.1 
 
 		 686 aa  90.1  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06531  Putative uncharacterized proteinVpsB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKB1]  21.77 
 
 		 593 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49379  predicted protein  22.27 
 
 		 565 aa  77  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102276  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36720  predicted protein  24.18 
 
 		 555 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04724  Sec1 family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G10810)  20 
 
 		 687 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06430  hypothetical protein  41.03 
 
 		 776 aa  55.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59543  Vacuolar sorting protein VPS33/slp1 (Sec1 family)  22.58 
 
 		 707 aa  48.9  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0683102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>