14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52201 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_52201  Vesicle trafficking protein Sly1 (Sec1 family)  100 
 
 		 645 aa  1313    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0194128  normal  0.444836 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02518  Golgi transport protein Sly1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14320)  42.01 
 
 		 527 aa  344  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00923388  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00420  SLY1 protein, putative  35.93 
 
 		 764 aa  335  1e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40796  predicted protein  32.02 
 
 		 641 aa  313  9e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43202  predicted protein  31.51 
 
 		 648 aa  286  7e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.197482  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11956  predicted protein  25.06 
 
 		 588 aa  111  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51437  predicted protein  21.77 
 
 		 620 aa  104  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0608965  hitchhiker  0.00430035 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06531  Putative uncharacterized proteinVpsB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKB1]  20.91 
 
 		 593 aa  90.5  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49379  predicted protein  20.19 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102276  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01300  VpsB, putative  23.73 
 
 		 686 aa  77.4  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06430  hypothetical protein  22.22 
 
 		 776 aa  74.3  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04724  Sec1 family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G10810)  21.12 
 
 		 687 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35091  predicted protein  23.58 
 
 		 721 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36720  predicted protein  22.75 
 
 		 555 aa  54.3  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>