19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01300 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB01300  VpsB, putative  100 
 
 		 686 aa  1403    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06531  Putative uncharacterized proteinVpsB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKB1]  46.04 
 
 		 593 aa  522  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49379  predicted protein  37.52 
 
 		 565 aa  372  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102276  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36720  predicted protein  37.39 
 
 		 555 aa  343  5e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82683  vacuolar protein sorting associated protein  29.15 
 
 		 614 aa  243  7e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40796  predicted protein  26.49 
 
 		 641 aa  103  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51437  predicted protein  23.37 
 
 		 620 aa  95.9  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0608965  hitchhiker  0.00430035 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04724  Sec1 family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G10810)  22.28 
 
 		 687 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11956  predicted protein  23.31 
 
 		 588 aa  95.1  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43202  predicted protein  23.46 
 
 		 648 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.197482  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00420  SLY1 protein, putative  21.51 
 
 		 764 aa  77.8  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52201  Vesicle trafficking protein Sly1 (Sec1 family)  23.63 
 
 		 645 aa  74.7  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0194128  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06430  hypothetical protein  21.68 
 
 		 776 aa  63.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01770  ATP binding protein, putative  23.04 
 
 		 672 aa  54.3  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02418  Putative uncharacterized proteinVacuolar sorting protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X126]  25.44 
 
 		 655 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234287  normal  0.0512937 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02518  Golgi transport protein Sly1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14320)  19.51 
 
 		 527 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00923388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42975  predicted protein  22.35 
 
 		 689 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35091  predicted protein  21.25 
 
 		 721 aa  50.8  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26965  predicted protein  22.5 
 
 		 759 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>