16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43202 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43202  predicted protein  100 
 
 		 648 aa  1340    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.197482  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52201  Vesicle trafficking protein Sly1 (Sec1 family)  30.95 
 
 		 645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0194128  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40796  predicted protein  33.44 
 
 		 641 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535356  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02518  Golgi transport protein Sly1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14320)  33.53 
 
 		 527 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00923388  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00420  SLY1 protein, putative  33.22 
 
 		 764 aa  253  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11956  predicted protein  24.53 
 
 		 588 aa  112  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51437  predicted protein  22.09 
 
 		 620 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0608965  hitchhiker  0.00430035 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06531  Putative uncharacterized proteinVpsB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKB1]  21.59 
 
 		 593 aa  100  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06430  hypothetical protein  24.36 
 
 		 776 aa  88.6  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01300  VpsB, putative  23.46 
 
 		 686 aa  82.4  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49379  predicted protein  22.25 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102276  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04724  Sec1 family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G10810)  20.76 
 
 		 687 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36720  predicted protein  24.94 
 
 		 555 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35091  predicted protein  22.04 
 
 		 721 aa  55.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01770  ATP binding protein, putative  20.39 
 
 		 672 aa  47.8  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59543  Vacuolar sorting protein VPS33/slp1 (Sec1 family)  25.49 
 
 		 707 aa  44.3  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0683102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>