16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40796 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_40796  predicted protein  100 
 
 
641 aa  1310    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535356  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00420  SLY1 protein, putative  36.41 
 
 
764 aa  343  5e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02518  Golgi transport protein Sly1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14320)  36.65 
 
 
527 aa  316  8e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00923388  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52201  Vesicle trafficking protein Sly1 (Sec1 family)  32.17 
 
 
645 aa  310  8e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0194128  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43202  predicted protein  33.49 
 
 
648 aa  291  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.197482  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11956  predicted protein  23.29 
 
 
588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51437  predicted protein  23.88 
 
 
620 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0608965  hitchhiker  0.00430035 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01300  VpsB, putative  25.78 
 
 
686 aa  108  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49379  predicted protein  23.77 
 
 
565 aa  108  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102276  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06531  Putative uncharacterized proteinVpsB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKB1]  21.57 
 
 
593 aa  96.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36720  predicted protein  22.82 
 
 
555 aa  88.6  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04724  Sec1 family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G10810)  23.97 
 
 
687 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06430  hypothetical protein  20.87 
 
 
776 aa  67.4  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82683  vacuolar protein sorting associated protein  20.26 
 
 
614 aa  58.2  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758582  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59543  Vacuolar sorting protein VPS33/slp1 (Sec1 family)  21.71 
 
 
707 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0683102 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42975  predicted protein  22.06 
 
 
689 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>