14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06430 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL06430  hypothetical protein  100 
 
 
776 aa  1621    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04724  Sec1 family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G10810)  32.17 
 
 
687 aa  340  5e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11956  predicted protein  25.89 
 
 
588 aa  226  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35091  predicted protein  27.42 
 
 
721 aa  211  5e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51437  predicted protein  26.25 
 
 
620 aa  210  8e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0608965  hitchhiker  0.00430035 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43202  predicted protein  24.58 
 
 
648 aa  88.6  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.197482  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49379  predicted protein  20.54 
 
 
565 aa  80.9  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102276  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02518  Golgi transport protein Sly1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14320)  22.03 
 
 
527 aa  74.7  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00923388  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52201  Vesicle trafficking protein Sly1 (Sec1 family)  22.22 
 
 
645 aa  68.9  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0194128  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40796  predicted protein  20.52 
 
 
641 aa  63.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535356  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01300  VpsB, putative  26.34 
 
 
686 aa  57.8  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00420  SLY1 protein, putative  35.58 
 
 
764 aa  54.3  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06531  Putative uncharacterized proteinVpsB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKB1]  18.52 
 
 
593 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82683  vacuolar protein sorting associated protein  20.54 
 
 
614 aa  48.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758582  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>