16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82683 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_82683  vacuolar protein sorting associated protein  100 
 
 		 614 aa  1223    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758582  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06531  Putative uncharacterized proteinVpsB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKB1]  33.23 
 
 		 593 aa  347  5e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01300  VpsB, putative  30.12 
 
 		 686 aa  282  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49379  predicted protein  27.46 
 
 		 565 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102276  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36720  predicted protein  26.62 
 
 		 555 aa  214  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04724  Sec1 family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G10810)  21.97 
 
 		 687 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40796  predicted protein  20.29 
 
 		 641 aa  82.8  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535356  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00420  SLY1 protein, putative  20.95 
 
 		 764 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51437  predicted protein  19.35 
 
 		 620 aa  73.9  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0608965  hitchhiker  0.00430035 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11956  predicted protein  19.66 
 
 		 588 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02518  Golgi transport protein Sly1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14320)  23.56 
 
 		 527 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00923388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52201  Vesicle trafficking protein Sly1 (Sec1 family)  21.64 
 
 		 645 aa  67.8  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0194128  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43202  predicted protein  20.36 
 
 		 648 aa  62  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.197482  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06430  hypothetical protein  17.96 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42975  predicted protein  25.97 
 
 		 689 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26965  predicted protein  37.93 
 
 		 759 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>