17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00890 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF00890  importin beta-4 subunit, putative  100 
 
 		 1080 aa  2214    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02120  importin subunit beta-4, putative (JCVI)  31.03 
 
 		 1093 aa  542  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69154  ran binding protein  30.14 
 
 		 1103 aa  463  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0595728  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23582  predicted protein  29.84 
 
 		 764 aa  244  7.999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41924  predicted protein  26.91 
 
 		 979 aa  173  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.123239  normal  0.112463 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36650  predicted protein  26.91 
 
 		 979 aa  173  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0159374  normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25726  predicted protein  22.89 
 
 		 1015 aa  165  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779434  decreased coverage  0.000347416 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05717  importin beta-3 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06790)  23.74 
 
 		 1095 aa  150  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69854  Karyopherin Functions in nuclear transport of proteins  21.75 
 
 		 1090 aa  144  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29967  predicted protein  21.26 
 
 		 871 aa  68.2  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.497541  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00906  Putative karyopherin/importin beta-1Putative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z9L0]  20.93 
 
 		 872 aa  63.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00266285  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00926  KapC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2LD07]  21.75 
 
 		 939 aa  61.6  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.335104  normal  0.533348 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01010  importin beta-2 subunit, putative  24.12 
 
 		 924 aa  55.8  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88418  karyopherin-beta  21.83 
 
 		 870 aa  55.8  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80310  predicted protein  30.07 
 
 		 938 aa  51.6  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36086  predicted protein  20.06 
 
 		 873 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.32944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  25.51 
 
 		 1237 aa  45.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>