1624 genes were found for organism Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
VEA_000001  CDS  NC_013457  30  1289  +  1260  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  YP_003287153  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000002  CDS  NC_013457  1290  1625  +  336  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  YP_003287154  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000003  CDS  NC_013457  1724  2128  -  405  predicted DNA-binding protein  YP_003287155  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000004  CDS  NC_013457  2130  2705  -  576  transcriptional regulator  YP_003287156  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000005  CDS  NC_013457  2850  3464  +  615  glutathione S-transferase  YP_003287157  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000006  CDS  NC_013457  3678  3938  +  261  hypothetical protein  YP_003287158  normal  0.663922  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000007  CDS  NC_013457  3968  5161  +  1194  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  YP_003287159  normal  0.441967  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000008  CDS  NC_013457  5185  5682  +  498  putative anti-sigma F factor antagonist  YP_003287160  normal  0.232541  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000009  CDS  NC_013457  5715  5906  -  192  hypothetical protein  YP_003287161  normal  0.0657287  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000010  CDS  NC_013457  5941  6276  -  336  HPT domain containing protein  YP_003287162  normal  0.0516719  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000011  CDS  NC_013457  6706  8856  -  2151  serine/threonine protein kinase  YP_003287163  normal  0.39315  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000012  CDS  NC_013457  9169  10362  +  1194  uncharacterized protein ImpI/VasC  YP_003287164  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000013  CDS  NC_013457  10374  10829  +  456  type VI secretion lipoprotein/VasD  YP_003287165  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000014  CDS  NC_013457  10887  12176  +  1290  uncharacterized protein ImpJ/VasE  YP_003287166  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000015  CDS  NC_013457  12188  13480  +  1293  Flagellar motor rotation protein MotB  YP_003287167  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000016  CDS  NC_013457  13497  17015  +  3519  IcmF-related protein  YP_003287168  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000017  CDS  NC_013457  16997  17692  +  696  protein phosphatase ImpM  YP_003287169  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000018  CDS  NC_013457  17702  18496  +  795  serine/threonine protein phosphatase  YP_003287170  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000019  CDS  NC_013457  18489  19607  +  1119  uncharacterized protein ImpA  YP_003287171  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000020  CDS  NC_013457  19623  20153  +  531  uncharacterized protein ImpB  YP_003287172  normal  0.100303  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000021  CDS  NC_013457  20153  21646  +  1494  uncharacterized protein ImpC  YP_003287173  normal  0.147425  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000022  CDS  NC_013457  21711  23210  +  1500  uncharacterized protein ImpD  YP_003287174  normal  0.507216  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000023  CDS  NC_013457  23221  24015  +  795  protein of avirulence locus ImpE  YP_003287175  normal  0.692484  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000024  CDS  NC_013457  24023  24487  +  465  uncharacterized protein ImpF  YP_003287176  normal  0.472951  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000025  CDS  NC_013457  24484  26307  +  1824  protein ImpG/VasA  YP_003287177  normal  0.536282  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000026  CDS  NC_013457  26304  27269  +  966  hypothetical protein  YP_003287178  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000027  CDS  NC_013457  27280  29847  +  2568  ClpB protein  YP_003287179  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000028  CDS  NC_013457  30056  30535  +  480  hemolysin-coregulated protein  YP_003287180  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000029  CDS  NC_013457  30584  32419  +  1836  hypothetical protein  YP_003287181  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000030  CDS  NC_013457  32431  32721  +  291  hypothetical protein  YP_003287182  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000031  CDS  NC_013457  32722  33561  +  840  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  YP_003287183  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000032  CDS  NC_013457  33886  35019  +  1134  exonuclease SbcD  YP_003287184  normal  0.526134  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000033  CDS  NC_013457  35029  38085  +  3057  exonuclease SbcC  YP_003287185  decreased coverage  0.00466596  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000034  CDS  NC_013457  38176  39090  -  915  transcriptional regulator LysR family protein  YP_003287186  decreased coverage  0.000511263  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000035  CDS  NC_013457  39689  40987  +  1299  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system large permease component  YP_003287188  hitchhiker  0.00960897  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000036  CDS  NC_013457  41000  42025  +  1026  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system component  YP_003287189  normal  0.128375  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000037  CDS  NC_013457  42084  43181  +  1098  nopaline dehydrogenase putative  YP_003287190  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000038  CDS  NC_013457  43165  43464  +  300  hypothetical protein  YP_003287191  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000039  CDS  NC_013457  43476  44939  +  1464  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_003287192  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000040  CDS  NC_013457  44908  45261  +  354  endoribonuclease L-PSP family protein  YP_003287193  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000041  CDS  NC_013457  45309  45689  -  381  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase component  YP_003287194  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000042  CDS  NC_013457  46004  46537  +  534  lipoprotein Blc  YP_003287195  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000043  CDS  NC_013457  46737  47732  -  996  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  YP_003287196  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000044  CDS  NC_013457  47841  49316  -  1476  membrane protein  YP_003287197  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000045  CDS  NC_013457  49577  49897  -  321  cytochrome c553  YP_003287198  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000046  CDS  NC_013457  49977  50981  -  1005  low-specificity L-threonine aldolase  YP_003287199  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000047  CDS  NC_013457  51004  51648  -  645  ADP-ribose pyrophosphatase  YP_003287200  normal  0.911513  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000048  CDS  NC_013457  51788  53449  +  1662  putative regulator protein  YP_003287201  normal  0.59899  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000049  CDS  NC_013457  53459  54913  +  1455  hypothetical protein  YP_003287202  normal  0.368804  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000050  CDS  NC_013457  55542  56444  +  903  transcriptional regulator LysR family  YP_003287203  normal  0.385466  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000051  CDS  NC_013457  56829  58535  +  1707  D-Lactate dehydrogenase  YP_003287204  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000052  CDS  NC_013457  58676  58984  -  309  putative transmembrane protein  YP_003287205  normal  0.323073  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000053  CDS  NC_013457  58981  59712  -  732  AzlC family protein  YP_003287206  normal  0.406334  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000054  CDS  NC_013457  60029  61258  -  1230  alanine racemase  YP_003287207  normal  0.194325  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000055  CDS  NC_013457  61459  63090  -  1632  methyl-accepting chemotaxis protein  YP_003287208  decreased coverage  0.000458726  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000056  CDS  NC_013457  64140  65663  +  1524  cytoplasmic alpha-amylase  YP_003287209  normal  0.0351894  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000057  CDS  NC_013457  65794  66048  +  255  hypothetical protein  YP_003287210  normal  0.0873504  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000058  CDS  NC_013457  66123  66773  -  651  lipase-related protein  YP_003287211  normal  0.161375  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000059  CDS  NC_013457  66980  67909  -  930  hypothetical protein  YP_003287212  normal  0.480452  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000060  CDS  NC_013457  67919  68092  -  174  hypothetical protein  YP_003287213  normal  0.2723  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000061  CDS  NC_013457  69390  71072  +  1683  peptidase M11 gametolysin  YP_003287214  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000062  CDS  NC_013457  71145  72335  -  1191  hypothetical protein  YP_003287215  normal  0.738723  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000063  CDS  NC_013457  73112  74707  +  1596  hypothetical protein  YP_003287216  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000064  CDS  NC_013457  74771  76555  -  1785  Ca2+-binding protein  YP_003287217  normal  0.731988  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000065  CDS  NC_013457  77035  77997  -  963  diguanylate cyclase/phosphodiesterase domain 2  YP_003287218  normal  0.175883  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000066  CDS  NC_013457  78050  78166  +  117  hypothetical protein  YP_003287219  normal  0.0691784  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000067  CDS  NC_013457  78227  78634  -  408  regulator of nucleoside diphosphate kinase  YP_003287220  normal  0.0657287  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000068  CDS  NC_013457  79164  81728  +  2565  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  YP_003287221  normal  0.424217  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000069  CDS  NC_013457  81742  82065  +  324  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  YP_003287222  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000070  CDS  NC_013457  82109  82234  +  126  hypothetical protein  YP_003287223  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000071  CDS  NC_013457  82262  83113  +  852  nitrite transporter from formate/nitrite family  YP_003287224  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000072  CDS  NC_013457  83287  84045  +  759  uroporphyrinogen-III methyltransferase  YP_003287225  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000073  CDS  NC_013457  84059  84499  -  441  hypothetical protein  YP_003287226  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000074  CDS  NC_013457  84617  85105  +  489  hypothetical protein  YP_003287227  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000075  CDS  NC_013457  85194  86525  -  1332  C4-dicarboxylate like transporter  YP_003287228  normal  0.834607  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000076  CDS  NC_013457  86713  86844  +  132  hypothetical protein  YP_003287229  normal  0.703104  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000077  CDS  NC_013457  86947  87684  +  738  hypothetical protein in aerobactin uptake cluster  YP_003287230  normal  0.455536  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000078  CDS  NC_013457  87774  89945  +  2172  aerobactin siderophore receptor iutA  YP_003287231  normal  0.709087  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000079  CDS  NC_013457  89999  90190  -  192  hypothetical protein  YP_003287232  normal  0.231186  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000080  CDS  NC_013457  90327  90836  +  510  putative acetyltransferase  YP_003287233  normal  0.241329  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000081  CDS  NC_013457  90850  91239  +  390  hypothetical protein  YP_003287234  normal  0.281171  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000082  CDS  NC_013457  91288  92448  -  1161  permease  YP_003287235  normal  0.0172441  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000083  CDS  NC_013457  92625  93059  -  435  thioredoxin 2  YP_003287236  normal  0.396729  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000084  CDS  NC_013457  93222  94316  +  1095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III protein 2  YP_003287237  normal  0.61467  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000085  CDS  NC_013457  94403  95728  -  1326  DUF1501 domain-containing protein  YP_003287238  normal  0.40571  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000086  CDS  NC_013457  95738  97306  -  1569  hypothetical protein  YP_003287239  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000087  CDS  NC_013457  97714  98976  -  1263  hydroxymethylglutaryl-CoA reductase  YP_003287240  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000088  CDS  NC_013457  99327  100562  -  1236  mannose-6-phosphate isomerase  YP_003287241  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000089  CDS  NC_013457  100687  102027  -  1341  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  YP_003287242  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000090  CDS  NC_013457  102034  103536  -  1503  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  YP_003287243  normal  1  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000091  CDS  NC_013457  103536  104144  -  609  transcriptional regulatory protein UhpA  YP_003287244  normal  0.136186  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000092  CDS  NC_013457  104291  105619  -  1329  hexose phosphate transport protein  YP_003287245  normal  0.149187  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000093  CDS  NC_013457  106092  106922  -  831  formate dehydrogenase chain D  YP_003287246  normal  0.257578  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000094  CDS  NC_013457  106976  107860  -  885  Transcriptional regulator, LysR family  YP_003287247  normal  0.289654  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000095  CDS  NC_013457  108529  110853  +  2325  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  YP_003287248  normal  0.940943  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000096  CDS  NC_013457  111193  111627  +  435  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  YP_003287249  normal  0.482372  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000097  CDS  NC_013457  111769  112569  +  801  phenazine biosynthesis PhzF family protein  YP_003287250  normal  0.55856  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000098  CDS  NC_013457  112714  113409  +  696  aspartate racemase  YP_003287251  normal  0.220289  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000099  CDS  NC_013457  113486  115189  -  1704  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_003287252  normal  0.251231  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
VEA_000100  CDS  NC_013457  115261  115446  -  186  hypothetical protein  YP_003287253  normal  0.136793  n/a    Vibrio sp. Ex25  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>