13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000052 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000052  putative transmembrane protein  100 
 
 		 102 aa  194  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.323073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2037  putative transmembrane protein  70.11 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2876  branched-chain amino acid transport  58 
 
 		 103 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0584958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  50 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1319  branched-chain amino acid transport  34.88 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1825  branched chain amino acid ABC transporter  33.72 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  30 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4139  branched-chain amino acid transport  33.71 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4738  branched-chain amino acid transport  30.43 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  42.47 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0696  branched-chain amino acid transport  25.56 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  39.62 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  29.17 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>