12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000073 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000073  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  307  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05688  hypothetical protein  73.29 
 
 
146 aa  243  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  31.45 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  27.66 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3971  hypothetical protein  32.67 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0415  hypothetical protein  28.95 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0438215  hitchhiker  0.000233911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  30.83 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0724  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108952  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  25.44 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>