209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000048 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  100 
 
 
553 aa  1144    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  61.37 
 
 
546 aa  694    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  74.19 
 
 
552 aa  868    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  91.14 
 
 
553 aa  1036    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  44.53 
 
 
498 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  44.34 
 
 
498 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  44.53 
 
 
498 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  44.16 
 
 
506 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  44.53 
 
 
498 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.34 
 
 
498 aa  422  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  44.34 
 
 
498 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  44.34 
 
 
498 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  43.1 
 
 
498 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  42.29 
 
 
499 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  43.21 
 
 
498 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  42.91 
 
 
498 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  42.91 
 
 
498 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  42.97 
 
 
498 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  43.26 
 
 
499 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  63.27 
 
 
523 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  58.15 
 
 
498 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  43.48 
 
 
499 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  42.94 
 
 
498 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  63.27 
 
 
512 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  63.27 
 
 
512 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  43.71 
 
 
468 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  63.27 
 
 
512 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  45.02 
 
 
543 aa  295  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  43.22 
 
 
530 aa  291  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.92 
 
 
528 aa  278  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.78 
 
 
526 aa  266  8.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  42.76 
 
 
560 aa  250  5e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  46.23 
 
 
489 aa  243  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  44.9 
 
 
509 aa  243  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  44.59 
 
 
509 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  36.9 
 
 
506 aa  228  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.33 
 
 
375 aa  223  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  40.5 
 
 
547 aa  216  8e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  37.75 
 
 
498 aa  210  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  43.21 
 
 
464 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  42.14 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  39.66 
 
 
382 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.37 
 
 
389 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.37 
 
 
407 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.46 
 
 
436 aa  170  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.04 
 
 
477 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  34.44 
 
 
376 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.2 
 
 
382 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34 
 
 
387 aa  153  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  32.73 
 
 
390 aa  149  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.96 
 
 
383 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  35.29 
 
 
368 aa  104  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  37.5 
 
 
368 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  34.59 
 
 
368 aa  102  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  36 
 
 
368 aa  101  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  33.33 
 
 
379 aa  93.2  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.66 
 
 
334 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.64 
 
 
285 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  21.2 
 
 
315 aa  60.5  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  23.96 
 
 
332 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  22.34 
 
 
318 aa  59.3  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  24.39 
 
 
303 aa  57.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.56 
 
 
313 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1639  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.01 
 
 
302 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.859939  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  26.34 
 
 
303 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.84 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.66 
 
 
325 aa  56.2  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  24.91 
 
 
332 aa  54.7  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  22.81 
 
 
331 aa  54.7  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  23.08 
 
 
336 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  23.84 
 
 
335 aa  54.3  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  24.48 
 
 
333 aa  54.3  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.34 
 
 
336 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  21.99 
 
 
310 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.79 
 
 
356 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  22.79 
 
 
308 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.74 
 
 
320 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  23.37 
 
 
310 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  25.47 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  24.48 
 
 
357 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  27.64 
 
 
356 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  21.99 
 
 
310 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.81 
 
 
378 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  21.99 
 
 
310 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.11 
 
 
327 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  21.65 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  28.75 
 
 
324 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  24.74 
 
 
369 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  23.67 
 
 
309 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  23.6 
 
 
371 aa  51.6  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  24.03 
 
 
349 aa  50.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  23.05 
 
 
333 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  23.33 
 
 
309 aa  50.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  21.99 
 
 
309 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  26.63 
 
 
310 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.07 
 
 
345 aa  50.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  26.63 
 
 
310 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  22.22 
 
 
343 aa  50.4  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  24.05 
 
 
345 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  23.96 
 
 
303 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>