109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0187 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0187  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  568  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1570  hypothetical protein  41.31 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  unclonable  0.0000135434 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4358  hypothetical protein  38.29 
 
 		 287 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0722174  normal  0.346082 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0677  hypothetical protein  42.54 
 
 		 153 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.88 
 
 		 761 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0678  hypothetical protein  46.15 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.45859  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1573  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000229166  decreased coverage  0.000000804561 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.73 
 
 		 791 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.99 
 
 		 789 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 		 451 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  25.31 
 
 		 888 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  22.76 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1174  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  23.34 
 
 		 761 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000121236  hitchhiker  0.000000673843 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  21.9 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.23 
 
 		 840 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.55 
 
 		 802 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.5 
 
 		 840 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  20.7 
 
 		 872 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.43 
 
 		 766 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  24.43 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  27.5 
 
 		 773 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  25.29 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  21.79 
 
 		 331 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2129  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.63 
 
 		 829 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326593  normal  0.0900672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  22.06 
 
 		 367 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.56 
 
 		 801 aa  52.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.65 
 
 		 778 aa  52  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.68 
 
 		 818 aa  52.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0492  beta-lactamase-like  23.48 
 
 		 338 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.565585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  22.51 
 
 		 406 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26 
 
 		 839 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  23.08 
 
 		 390 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3769  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 		 498 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0736  putative competence-related protein  26.26 
 
 		 768 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  24.88 
 
 		 461 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 453 aa  50.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.41 
 
 		 745 aa  49.7  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.62 
 
 		 772 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.62 
 
 		 772 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.12 
 
 		 773 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.46 
 
 		 759 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  21.85 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.25 
 
 		 773 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  23.16 
 
 		 291 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.11 
 
 		 783 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5966  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.65 
 
 		 829 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2111  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.65 
 
 		 829 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.261797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.25 
 
 		 654 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  24.15 
 
 		 461 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  22.87 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  22.96 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  24.15 
 
 		 461 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  21.03 
 
 		 443 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.38 
 
 		 770 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  22.48 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.68 
 
 		 773 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  22.93 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  22.93 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.28 
 
 		 815 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0132  ComEC/Rec2-related protein  22.07 
 
 		 979 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.807661  normal  0.0603201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0493  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.62 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.68 
 
 		 773 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  22.93 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  24.49 
 
 		 825 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.49 
 
 		 822 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  24.76 
 
 		 423 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 780 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.15 
 
 		 819 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.38 
 
 		 773 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.8 
 
 		 801 aa  46.2  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl027  DNA uptake protein  24.29 
 
 		 378 aa  46.2  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  24.04 
 
 		 879 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2803  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.89 
 
 		 769 aa  45.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  23.14 
 
 		 461 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.14 
 
 		 851 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.43 
 
 		 749 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 773 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.12 
 
 		 752 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.46 
 
 		 758 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.882312  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2423  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.76 
 
 		 773 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.57 
 
 		 682 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.82 
 
 		 798 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  23.67 
 
 		 461 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.79 
 
 		 790 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  22.94 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.44 
 
 		 750 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1682  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.54 
 
 		 783 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3143  copper amine oxidase domain-containing protein  27.03 
 
 		 455 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.700617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>