14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0677 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0677  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  321  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4358  hypothetical protein  62.34 
 
 		 287 aa  196  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0722174  normal  0.346082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1570  hypothetical protein  49.64 
 
 		 272 aa  142  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  unclonable  0.0000135434 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0187  hypothetical protein  42.54 
 
 		 269 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.21 
 
 		 761 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1571  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  27.33 
 
 		 320 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  hitchhiker  0.000158628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 451 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.79 
 
 		 811 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0828  metallo-beta-lactamase superfamily protein, putative  27.47 
 
 		 688 aa  41.2  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  31.58 
 
 		 746 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  29.33 
 
 		 454 aa  41.2  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.89 
 
 		 794 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1139  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  29.11 
 
 		 336 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0577692 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  27.14 
 
 		 292 aa  40.8  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>