232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3143 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3143  copper amine oxidase domain-containing protein  100 
 
 
455 aa  931    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.700617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  27.56 
 
 
502 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
451 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
294 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 
281 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  27.52 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  24.55 
 
 
454 aa  113  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  30.74 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 
320 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  29.86 
 
 
461 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  31.08 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  30.28 
 
 
461 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  29.92 
 
 
461 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 
451 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
421 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 
352 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  29.72 
 
 
284 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  29.88 
 
 
461 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  29.88 
 
 
461 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
406 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 
367 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 
300 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 
300 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.13 
 
 
778 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 
300 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  29.8 
 
 
300 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  29.15 
 
 
300 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.52 
 
 
789 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 
479 aa  97.1  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  28.63 
 
 
423 aa  97.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  28.98 
 
 
300 aa  96.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 
300 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  28.98 
 
 
300 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  28.98 
 
 
300 aa  96.7  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  28.98 
 
 
300 aa  96.7  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  28.98 
 
 
300 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.99 
 
 
750 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.41 
 
 
818 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  25.88 
 
 
443 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
300 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 
363 aa  93.6  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.62 
 
 
796 aa  93.6  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
453 aa  93.2  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 
318 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2283  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  27.31 
 
 
342 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  27.31 
 
 
291 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  26.02 
 
 
292 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  29.39 
 
 
795 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.73 
 
 
795 aa  89.7  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 
757 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.68 
 
 
791 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.63 
 
 
775 aa  87.8  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.78 
 
 
682 aa  87.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.45 
 
 
808 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  26.37 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.74 
 
 
809 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 
374 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.47 
 
 
814 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.95 
 
 
840 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1964  hypothetical protein  28.4 
 
 
283 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.51 
 
 
883 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.74 
 
 
679 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.17 
 
 
783 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1600  hydrolase of metallo-beta-lactamase fold  30.33 
 
 
281 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.949503  unclonable  2.1744e-23 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  24.89 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.4 
 
 
761 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  27.31 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.29 
 
 
777 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.71 
 
 
797 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.79 
 
 
811 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  28 
 
 
746 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  33.11 
 
 
175 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.73 
 
 
798 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  22.39 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  24.21 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.95 
 
 
780 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.9 
 
 
771 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.19 
 
 
773 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.19 
 
 
773 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.65 
 
 
786 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.17 
 
 
773 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.72 
 
 
806 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  32.03 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.91 
 
 
868 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.71 
 
 
752 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.81 
 
 
794 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.19 
 
 
784 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  24.64 
 
 
872 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
759 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.38 
 
 
773 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.19 
 
 
745 aa  67  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  34.85 
 
 
483 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.05 
 
 
749 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  25.3 
 
 
773 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  28.91 
 
 
452 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.91 
 
 
773 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.05 
 
 
797 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>