161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1964 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1964  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  564  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  33.06 
 
 
423 aa  112  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  31.2 
 
 
257 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 
451 aa  99  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2283  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  30.71 
 
 
342 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 
367 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  31.25 
 
 
336 aa  96.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
421 aa  96.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 
479 aa  89.4  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.18 
 
 
818 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  28.36 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3143  copper amine oxidase domain-containing protein  28.4 
 
 
455 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.700617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.06 
 
 
789 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.46 
 
 
778 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.17 
 
 
796 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.17 
 
 
814 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  25.94 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  30.2 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.61 
 
 
750 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  25.21 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  26.1 
 
 
795 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  24.79 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  28.9 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.11 
 
 
795 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  26.41 
 
 
406 aa  77  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  23.77 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  27.8 
 
 
461 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  27.44 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.08 
 
 
794 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  23.41 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  25.91 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 
791 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  25.91 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.07 
 
 
771 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  26.56 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  26.56 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  26.95 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  26.32 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.52 
 
 
752 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 
839 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  26.95 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  25.1 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  25.78 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.45 
 
 
809 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  26.76 
 
 
847 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.16 
 
 
840 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.95 
 
 
798 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  25.67 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  23.97 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.91 
 
 
775 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.1 
 
 
757 aa  62.4  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.45 
 
 
808 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  25.52 
 
 
738 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.82 
 
 
781 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
386 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.12 
 
 
798 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.76 
 
 
734 aa  60.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.45 
 
 
745 aa  60.1  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.04 
 
 
786 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.84 
 
 
766 aa  59.3  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.09 
 
 
746 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
812 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  26.04 
 
 
888 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  23.21 
 
 
773 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.62 
 
 
772 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.98 
 
 
811 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
840 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  25.58 
 
 
502 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.65 
 
 
773 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.9 
 
 
773 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  27.27 
 
 
872 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1600  hydrolase of metallo-beta-lactamase fold  23.77 
 
 
281 aa  55.8  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.949503  unclonable  2.1744e-23 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.61 
 
 
761 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.36 
 
 
773 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.87 
 
 
773 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.64 
 
 
792 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  22.13 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.87 
 
 
654 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.88 
 
 
722 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0715  hypothetical protein  36.59 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.71 
 
 
802 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  25.09 
 
 
872 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.39 
 
 
770 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2715  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.03 
 
 
842 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0547  ComEC/Rec2-related protein  23.33 
 
 
900 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  25.08 
 
 
374 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>