More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1419 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1528  putative semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
336 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0362  putative semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
336 aa  677    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.857997  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1419  putative semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
336 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3335  putative semialdehyde dehydrogenase  87.5 
 
 
336 aa  614  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0020501  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1367  putative semialdehyde dehydrogenase  82.39 
 
 
336 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1464  putative semialdehyde dehydrogenase  80.6 
 
 
336 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2801  putative semialdehyde dehydrogenase  80.9 
 
 
336 aa  556  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.778935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2577  putative semialdehyde dehydrogenase  77.91 
 
 
336 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02244  hypothetical protein  71.81 
 
 
337 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1337  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
337 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2511  putative semialdehyde dehydrogenase  71.51 
 
 
337 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2613  putative semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
337 aa  500  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2557  putative semialdehyde dehydrogenase  71.51 
 
 
337 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1333  putative semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
337 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.945018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2475  putative semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
337 aa  500  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3459  putative semialdehyde dehydrogenase  71.51 
 
 
337 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2720  putative semialdehyde dehydrogenase  71.51 
 
 
337 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2470  putative semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
337 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2599  putative semialdehyde dehydrogenase  71.51 
 
 
337 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2697  putative semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
337 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02204  hypothetical protein  71.81 
 
 
337 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2611  putative semialdehyde dehydrogenase  71.22 
 
 
337 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  normal  0.0361352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2868  putative semialdehyde dehydrogenase  70.62 
 
 
337 aa  460  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.15 
 
 
337 aa  345  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03103  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.36 
 
 
337 aa  335  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002872  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.76 
 
 
337 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797453  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.66 
 
 
338 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1393  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
338 aa  326  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2308  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.83 
 
 
338 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000121331  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2152  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
338 aa  324  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000198984  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1613  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.54 
 
 
338 aa  322  5e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000186594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.43 
 
 
338 aa  322  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000971394  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3070  aspartate semialdehyde dehydrogenese  46.73 
 
 
338 aa  322  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1650  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.83 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00338188  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
338 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000159168  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1615  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
338 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000415846  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2744  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
338 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000610142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2761  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
338 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339959  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2443  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.83 
 
 
338 aa  318  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000737036  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1477  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.83 
 
 
338 aa  318  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000311076  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1424  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.54 
 
 
338 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000300384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1489  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.54 
 
 
338 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000183684  normal  0.923378 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3805  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
339 aa  311  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45 
 
 
340 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1484  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  44.05 
 
 
338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0171916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.84 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  42.94 
 
 
340 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.94 
 
 
340 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01202  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.49 
 
 
338 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.76 
 
 
340 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0800  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  40.88 
 
 
340 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.65 
 
 
340 aa  289  4e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0940  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.34 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.281567  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.24 
 
 
340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.52 
 
 
341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
340 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.07 
 
 
340 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.07 
 
 
340 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
342 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.62 
 
 
341 aa  255  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
339 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
339 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
339 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
339 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
340 aa  248  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.18 
 
 
344 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.18 
 
 
344 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.47 
 
 
339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.23 
 
 
341 aa  245  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1894  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
336 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.98 
 
 
344 aa  239  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  38.24 
 
 
339 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.09 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.98 
 
 
344 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
340 aa  233  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3240  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
340 aa  229  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.01 
 
 
344 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2718  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.87 
 
 
341 aa  229  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3819  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.23 
 
 
337 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205266  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
357 aa  228  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
344 aa  228  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
337 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.8 
 
 
344 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
344 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1992  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.9 
 
 
334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550261  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3769  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.9 
 
 
334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614243  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.09 
 
 
344 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1526  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
334 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1553  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
334 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.340433 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0114  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.04 
 
 
340 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.9 
 
 
339 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.9 
 
 
339 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.76 
 
 
348 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.8 
 
 
344 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.23 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.65 
 
 
345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.57 
 
 
345 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>