More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1337 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02244  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  680    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1337  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  680    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02204  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  680    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1333  putative semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  680    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.945018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2697  putative semialdehyde dehydrogenase  99.7 
 
 
337 aa  678    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2613  putative semialdehyde dehydrogenase  99.7 
 
 
337 aa  678    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2470  putative semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  680    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2475  putative semialdehyde dehydrogenase  99.7 
 
 
337 aa  678    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3459  putative semialdehyde dehydrogenase  99.7 
 
 
337 aa  679    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2720  putative semialdehyde dehydrogenase  89.02 
 
 
337 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2599  putative semialdehyde dehydrogenase  89.02 
 
 
337 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2511  putative semialdehyde dehydrogenase  89.02 
 
 
337 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2557  putative semialdehyde dehydrogenase  89.02 
 
 
337 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2611  putative semialdehyde dehydrogenase  88.72 
 
 
337 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  normal  0.0361352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2868  putative semialdehyde dehydrogenase  81.6 
 
 
337 aa  542  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1419  putative semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
336 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0362  putative semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
336 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.857997  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1528  putative semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
336 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1367  putative semialdehyde dehydrogenase  71.13 
 
 
336 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3335  putative semialdehyde dehydrogenase  71.22 
 
 
336 aa  491  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0020501  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2801  putative semialdehyde dehydrogenase  68.75 
 
 
336 aa  477  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.778935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1464  putative semialdehyde dehydrogenase  68.45 
 
 
336 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2577  putative semialdehyde dehydrogenase  68.45 
 
 
336 aa  477  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03103  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.07 
 
 
337 aa  322  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002872  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.18 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797453  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.63 
 
 
338 aa  316  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2443  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000737036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2761  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000159168  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2744  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000610142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1615  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000415846  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1477  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
338 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000311076  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3070  aspartate semialdehyde dehydrogenese  45.86 
 
 
338 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1424  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.56 
 
 
338 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000300384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1489  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.56 
 
 
338 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000183684  normal  0.923378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2308  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000121331  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3805  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2152  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.95 
 
 
338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000198984  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1393  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.49 
 
 
338 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1650  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.2 
 
 
338 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00338188  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.79 
 
 
338 aa  298  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000971394  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1484  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  43.79 
 
 
338 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0171916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
340 aa  296  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1613  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.9 
 
 
338 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000186594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.41 
 
 
338 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01202  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
338 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
340 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  41.35 
 
 
340 aa  279  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
340 aa  279  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0800  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  39.59 
 
 
340 aa  275  8e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000180575  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.06 
 
 
340 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.72 
 
 
340 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.36 
 
 
341 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0940  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.41 
 
 
340 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.281567  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 
340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 
340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.18 
 
 
340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.47 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.64 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.64 
 
 
339 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.53 
 
 
345 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.35 
 
 
339 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.28 
 
 
340 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1894  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
336 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
342 aa  235  8e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.6 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
341 aa  232  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  39.77 
 
 
339 aa  232  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
341 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2718  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.47 
 
 
341 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.58 
 
 
344 aa  228  9e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.58 
 
 
344 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.06 
 
 
342 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  36.18 
 
 
339 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.8 
 
 
344 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.8 
 
 
344 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3240  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.91 
 
 
340 aa  225  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.92 
 
 
340 aa  225  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0114  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
340 aa  225  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0034  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
340 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3459  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
340 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.09 
 
 
345 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.13 
 
 
344 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.5 
 
 
344 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0044  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.92 
 
 
340 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1376  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.92 
 
 
340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0300827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3819  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.23 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205266  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.13 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.28 
 
 
359 aa  220  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.09 
 
 
344 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.2 
 
 
357 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.5 
 
 
344 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.69 
 
 
344 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.5 
 
 
344 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
339 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
339 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>