More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2599 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2720  putative semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2557  putative semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2611  putative semialdehyde dehydrogenase  99.7 
 
 
337 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  normal  0.0361352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2511  putative semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2599  putative semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  0.712665 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02244  hypothetical protein  89.02 
 
 
337 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1337  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  89.02 
 
 
337 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1333  putative semialdehyde dehydrogenase  89.02 
 
 
337 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.945018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2613  putative semialdehyde dehydrogenase  89.02 
 
 
337 aa  626  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2470  putative semialdehyde dehydrogenase  89.02 
 
 
337 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2475  putative semialdehyde dehydrogenase  89.02 
 
 
337 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02204  hypothetical protein  89.02 
 
 
337 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3459  putative semialdehyde dehydrogenase  88.72 
 
 
337 aa  624  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2697  putative semialdehyde dehydrogenase  89.02 
 
 
337 aa  626  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2868  putative semialdehyde dehydrogenase  81.6 
 
 
337 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1367  putative semialdehyde dehydrogenase  72.92 
 
 
336 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1419  putative semialdehyde dehydrogenase  71.51 
 
 
336 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0362  putative semialdehyde dehydrogenase  71.51 
 
 
336 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.857997  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1528  putative semialdehyde dehydrogenase  71.51 
 
 
336 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3335  putative semialdehyde dehydrogenase  70.62 
 
 
336 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0020501  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2801  putative semialdehyde dehydrogenase  70.24 
 
 
336 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.778935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2577  putative semialdehyde dehydrogenase  70.24 
 
 
336 aa  481  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1464  putative semialdehyde dehydrogenase  70.24 
 
 
336 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03103  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1615  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.67 
 
 
338 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000415846  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2744  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.67 
 
 
338 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000610142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2761  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.67 
 
 
338 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.67 
 
 
338 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000159168  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002872  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.7 
 
 
337 aa  305  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797453  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.75 
 
 
338 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2443  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
338 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000737036  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.1 
 
 
337 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1477  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.72 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000311076  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3070  aspartate semialdehyde dehydrogenese  45.43 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1424  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.43 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000300384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1489  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.43 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000183684  normal  0.923378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2152  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
338 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000198984  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1393  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.08 
 
 
338 aa  299  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3805  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.25 
 
 
339 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1484  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  43.79 
 
 
338 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0171916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2308  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.95 
 
 
338 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000121331  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1613  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
338 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000186594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1650  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
338 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00338188  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
340 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.36 
 
 
338 aa  288  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000971394  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.53 
 
 
338 aa  285  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.64 
 
 
340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01202  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
338 aa  278  7e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.52 
 
 
340 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  42.23 
 
 
340 aa  276  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0800  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  40.18 
 
 
340 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000180575  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.06 
 
 
340 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.06 
 
 
340 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.35 
 
 
340 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.41 
 
 
340 aa  257  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0940  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
340 aa  253  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.281567  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 
340 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 
340 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.3 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.88 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.3 
 
 
339 aa  242  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.71 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.71 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 
345 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
341 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.99 
 
 
340 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1894  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
336 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  39.3 
 
 
339 aa  231  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.6 
 
 
342 aa  229  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  35.88 
 
 
339 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.88 
 
 
342 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.54 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3819  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.42 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205266  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.43 
 
 
341 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2718  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 
341 aa  219  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.69 
 
 
344 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.69 
 
 
344 aa  219  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.26 
 
 
340 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.97 
 
 
337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
345 aa  215  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.8 
 
 
344 aa  215  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
344 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1993  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.91 
 
 
360 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.496335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.99 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.06 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3240  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.72 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.21 
 
 
344 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1526  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.36 
 
 
334 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
336 aa  211  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0034  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.01 
 
 
340 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3459  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.76 
 
 
340 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.4 
 
 
339 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.4 
 
 
339 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.74 
 
 
340 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.39 
 
 
344 aa  209  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1376  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.64 
 
 
340 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0300827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.9 
 
 
341 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0114  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
340 aa  209  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3769  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.88 
 
 
334 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>