87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3006 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2476  hypothetical protein  98.64 
 
 
786 aa  1264    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3006  hypothetical protein  100 
 
 
723 aa  1493    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000272856  hitchhiker  0.000454195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2574  hypothetical protein  98.64 
 
 
786 aa  1265    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.710488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  22.98 
 
 
804 aa  104  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  21.75 
 
 
818 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  22.26 
 
 
806 aa  95.1  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  22.09 
 
 
808 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  21.14 
 
 
805 aa  91.3  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  21.79 
 
 
802 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  21.79 
 
 
811 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  20.31 
 
 
801 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  21.23 
 
 
807 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  20.66 
 
 
791 aa  80.9  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  20.33 
 
 
805 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 
800 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  20.82 
 
 
807 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  22.52 
 
 
795 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  20.41 
 
 
804 aa  78.2  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  19.97 
 
 
805 aa  77.4  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  19.15 
 
 
792 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  21.44 
 
 
785 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3637  protein of unknown function DUF214  21.11 
 
 
834 aa  73.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000286021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  19.74 
 
 
798 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  19.91 
 
 
789 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  22.59 
 
 
770 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  19.09 
 
 
813 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  20.84 
 
 
817 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  22.2 
 
 
793 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  21.82 
 
 
801 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  19.66 
 
 
798 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  21.73 
 
 
795 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  21.12 
 
 
788 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  18.85 
 
 
777 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  20.42 
 
 
789 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  22.24 
 
 
804 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0208  lateral flagellin  44.74 
 
 
388 aa  64.3  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  18.64 
 
 
800 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  21.04 
 
 
800 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  20.22 
 
 
793 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  22.05 
 
 
816 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  17.8 
 
 
810 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  19.76 
 
 
802 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  19.49 
 
 
800 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  20 
 
 
811 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  23.14 
 
 
785 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  19.81 
 
 
789 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  19.68 
 
 
802 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  100 
 
 
1050 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  20.86 
 
 
790 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1245  hypothetical protein  96 
 
 
478 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000245393  hitchhiker  0.000000000053439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 
801 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  21.94 
 
 
803 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  19.54 
 
 
790 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  20.2 
 
 
816 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  20.99 
 
 
797 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  20.67 
 
 
792 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  20.26 
 
 
793 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  19.8 
 
 
794 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  20.18 
 
 
836 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  20.28 
 
 
794 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  20.19 
 
 
798 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  20.64 
 
 
809 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  20.61 
 
 
784 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  18.77 
 
 
784 aa  53.9  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  20.47 
 
 
802 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  20.49 
 
 
811 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  21.3 
 
 
792 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  20.8 
 
 
780 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  22.85 
 
 
791 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  20.71 
 
 
797 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  21.5 
 
 
802 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  22.56 
 
 
797 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  19.16 
 
 
801 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  22.08 
 
 
804 aa  51.6  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4639  protein of unknown function DUF214  19.64 
 
 
791 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  22.46 
 
 
786 aa  50.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  20.54 
 
 
809 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  18.34 
 
 
800 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  21.02 
 
 
784 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  19.21 
 
 
793 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  20.38 
 
 
797 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  21.28 
 
 
811 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  19.88 
 
 
791 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  20 
 
 
799 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2599  protein of unknown function DUF214  22.61 
 
 
812 aa  46.6  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  20.77 
 
 
809 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5424  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 
803 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00458607  normal  0.0384423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>