47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0325 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2956  outer membrane porin  68.38 
 
 		 468 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00243761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00629  hypothetical protein  68.16 
 
 		 468 aa  647    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0734  outer membrane porin, OprD family  67.31 
 
 		 468 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.897732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0843  outer membrane porin, OprD family  67.31 
 
 		 468 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0807  OprD family outer membrane porin  67.31 
 
 		 468 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0746  outer membrane porin, OprD family  67.09 
 
 		 468 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0569  outer membrane porin, OprD family  67.95 
 
 		 468 aa  646    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000403252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0703  OprD family outer membrane porin  67.51 
 
 		 468 aa  648    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000220662  normal  0.949628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2975  outer membrane porin  68.16 
 
 		 468 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2993  outer membrane porin  99.58 
 
 		 473 aa  967    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0325  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 473 aa  971    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038295  normal  0.923743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1230  outer membrane porin  69.23 
 
 		 467 aa  659    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.033366  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0709  porin D  68.16 
 
 		 468 aa  647    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000316757  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0728  OprD family outer membrane porin  68.16 
 
 		 468 aa  647    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00197385  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2905  OprD family outer membrane porin  99.37 
 
 		 473 aa  964    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0155537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00638  predicted outer membrane porin  68.16 
 
 		 468 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1196  outer membrane porin  67.81 
 
 		 465 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000266112  decreased coverage  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1391  outer membrane porin  42.98 
 
 		 447 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01313  hypothetical protein  34.22 
 
 		 461 aa  192  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004152  N-acetylglucosamine-regulated outer membrane porin  30.04 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.569888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  24.31 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  23.26 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  22.8 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  24.64 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  22.72 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  22.72 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  24.15 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0883  outer membrane porin  24.09 
 
 		 459 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  23.08 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0922  outer membrane porin  23.87 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  21.61 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  21.4 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  22.4 
 
 		 442 aa  50.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0926  outer membrane porin  24.41 
 
 		 459 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  22.92 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  24.49 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  22.99 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  23.55 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  23.39 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  22.7 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  22.7 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  22.7 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  22.7 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  26.21 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  22.9 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  22.34 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  25.21 
 
 		 455 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>