20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004152 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004152  N-acetylglucosamine-regulated outer membrane porin  100 
 
 		 469 aa  951    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.569888  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2905  OprD family outer membrane porin  30.24 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0155537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0325  OprD family outer membrane porin  30.04 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038295  normal  0.923743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2993  outer membrane porin  30.24 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1196  outer membrane porin  30.06 
 
 		 465 aa  136  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000266112  decreased coverage  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1230  outer membrane porin  29.5 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.033366  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2975  outer membrane porin  28.91 
 
 		 468 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00629  hypothetical protein  28.91 
 
 		 468 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0703  OprD family outer membrane porin  28.91 
 
 		 468 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000220662  normal  0.949628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00638  predicted outer membrane porin  28.91 
 
 		 468 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0728  OprD family outer membrane porin  28.91 
 
 		 468 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00197385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0709  porin D  28.71 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000316757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0569  outer membrane porin, OprD family  28.71 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000403252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2956  outer membrane porin  28.71 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00243761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0807  OprD family outer membrane porin  28.94 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0843  outer membrane porin, OprD family  28.94 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0734  outer membrane porin, OprD family  28.94 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.897732  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0746  outer membrane porin, OprD family  28.85 
 
 		 468 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01313  hypothetical protein  29.47 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1391  outer membrane porin  26.99 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>