184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3658 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3529  putative fructose-like permease EIIC subunit 2  100 
 
 
360 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0866  putative fructose-like permease EIIC subunit 2  97.8 
 
 
364 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3658  putative fructose-like permease EIIC subunit 2  100 
 
 
360 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4443  putative fructose-like permease EIIC subunit 2  82.11 
 
 
359 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.35226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4517  putative fructose-like permease EIIC subunit 2  82.11 
 
 
359 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540443 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03834  predicted enzyme IIC component of PTS  76.88 
 
 
359 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4037  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  76.88 
 
 
359 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03783  hypothetical protein  76.88 
 
 
359 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4183  putative fructose-like permease EIIC subunit 2  76.88 
 
 
359 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4488  putative fructose-like permease EIIC subunit 2  76.88 
 
 
359 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5409  putative fructose-like permease EIIC subunit 2  76.88 
 
 
359 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4067  putative fructose-like permease EIIC subunit 2  76.88 
 
 
359 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4396  putative fructose-like permease EIIC subunit 2  76.88 
 
 
359 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.448765 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1934  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  59.1 
 
 
352 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0825  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  49.29 
 
 
348 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05188  PTS system fructose-specific IIABC component  44.94 
 
 
623 aa  285  8e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001309  phosphotransferase system fructose-specific  43.54 
 
 
623 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3394  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  49.26 
 
 
467 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0149  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  49.24 
 
 
454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1417  PTS system, fructose-specific IIABC component  45.51 
 
 
621 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1416  PTS system, fructose-specific IIBC component  45.45 
 
 
467 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06592  PTS system fructose-specific IIBC component  45.21 
 
 
466 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1684  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  49.4 
 
 
464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000705  PTS system fructose-specific IIBC component  44.91 
 
 
466 aa  265  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0578  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  47.09 
 
 
452 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000494031  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2665  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  44.41 
 
 
650 aa  259  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2721  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  44.41 
 
 
650 aa  259  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1170  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  47.63 
 
 
648 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2897  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  45.76 
 
 
483 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.78081  hitchhiker  0.0087232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1970  PTS fructose IIC component  47.11 
 
 
575 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0995  PTS system, fructose-like permease IIC component  44.51 
 
 
467 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3110  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  44.14 
 
 
571 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05184  PTS system fructose-specific IIABC component  45.8 
 
 
635 aa  253  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2745  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  43.84 
 
 
571 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.853205  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0013  PTS fructose IIC component  44.65 
 
 
462 aa  252  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.991255  unclonable  0.00000000838432 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001305  phosphotransferase system fructose-specific  45.51 
 
 
635 aa  252  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0908  protein-N p-phosphohistidine-sugar phosphotransferase  44.68 
 
 
595 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.011028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2863  PTS system, fructose-specific IIBC component (EIIBC-fru) (fructose-permease IIBC component) transmembrane protein  45.18 
 
 
573 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24563  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0525  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  42.46 
 
 
680 aa  249  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00489  pts system fructose-specific eiibc component (eiibc-fru) (eii-fru)  48.51 
 
 
580 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4714  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  43.84 
 
 
483 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1421  PTS system, fructose-specific IIABC component  45.61 
 
 
633 aa  246  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0411  pts system, fructose-specific iiabc component  42.01 
 
 
625 aa  245  6.999999999999999e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0564  PTS system, fructose-specific, IIABC component  43.47 
 
 
630 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0299  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  41.96 
 
 
690 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.843252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0550  fructose specific permease  43.16 
 
 
630 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0639  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  45.8 
 
 
456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.392906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2260  PTS system, fructose-specific IIABC components  45.48 
 
 
646 aa  242  6e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0894  PTS system, IIBC component  47.08 
 
 
633 aa  242  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4250  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  44.07 
 
 
602 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401308  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2759  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  41.73 
 
 
392 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0066  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  39.95 
 
 
503 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411939  normal  0.45424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0612  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  44.58 
 
 
579 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0823  phosphotransferase system PTS, fructose-specific IIB subunit:PTS fructose IIC component  41.34 
 
 
580 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05960  PTS system fructose-specific IIBC component  42.18 
 
 
581 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000224  phosphotransferase system fructose-specific IIB and IIC subunit  42.77 
 
 
579 aa  235  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1512  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  42.86 
 
 
623 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0956  phosphotransferase system, fructose-specific IIBC component  41.64 
 
 
584 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0788  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  42.34 
 
 
574 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1062  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  43.52 
 
 
477 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0795  PTS fructose IIC component  41.03 
 
 
577 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.417507  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0449  PTS system, fructose-specific IIBC component  42.01 
 
 
580 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0649  pts system, fructose-specific iiabc component  39.16 
 
 
623 aa  232  6e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.83656  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2327  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  42.14 
 
 
562 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2649  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  43.47 
 
 
623 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0092  PTS system, fructose-specific IIBC component  41.59 
 
 
579 aa  230  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3406  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  41.92 
 
 
462 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0171984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1654  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.87 
 
 
563 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0114872  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4398  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  41.64 
 
 
579 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3553  PTS system fructose-specific IIBC protein  42.25 
 
 
575 aa  227  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.869517  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2424  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.44 
 
 
563 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1926  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.27 
 
 
563 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618406  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2175  phosphotransferase system, fructose IIC component  42.4 
 
 
607 aa  225  8e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0795  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  41.03 
 
 
580 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22320  PTS system IIA component/PTS system IIB component/PTS system IIC component  38.04 
 
 
708 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.215617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0080  phosphotransferase system, fructose IIC component  39.34 
 
 
671 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0089  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  39.34 
 
 
671 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0070  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  39.34 
 
 
671 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580369  normal  0.613567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0818  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  41.03 
 
 
580 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3228  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.46 
 
 
561 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2681  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.64 
 
 
566 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000131173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2665  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  45.03 
 
 
575 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.079848  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1526  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.64 
 
 
566 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032723  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2762  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.64 
 
 
566 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.913344  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0829  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  40.43 
 
 
580 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.645522  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1717  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  43.71 
 
 
456 aa  222  8e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.315956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1481  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.34 
 
 
563 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00261776  unclonable  0.0000000236485 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1491  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  41.03 
 
 
563 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000396602  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3303  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.03 
 
 
563 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000185462  normal  0.0412647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0094  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  41.18 
 
 
656 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2032  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  44.82 
 
 
568 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02055  hypothetical protein  41.03 
 
 
563 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0551082  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02096  fused fructose-specific PTS enzymes: IIBcomponent/IIC components  41.03 
 
 
563 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0370385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2304  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.03 
 
 
563 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000200462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2464  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.03 
 
 
563 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000333073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0796  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.03 
 
 
563 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00918032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2314  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  41.03 
 
 
563 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00422844  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2554  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  40.43 
 
 
562 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  hitchhiker  0.000294778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2440  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  40.43 
 
 
562 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29785  hitchhiker  0.0000687428 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2396  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  40.43 
 
 
562 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000856102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>