238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0449 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02096  fused fructose-specific PTS enzymes: IIBcomponent/IIC components  63.55 
 
 
563 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0370385  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1481  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  63.36 
 
 
563 aa  656    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00261776  unclonable  0.0000000236485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2352  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  62.76 
 
 
562 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000111546  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4189  PTS system fructose-specific eiibc component  72.31 
 
 
457 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.800706  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1491  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  63.53 
 
 
563 aa  654    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000396602  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2554  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  63.13 
 
 
562 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  hitchhiker  0.000294778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4083  pts system fructose-specific eiibc component  72.31 
 
 
457 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0795  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  60.87 
 
 
580 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0956  phosphotransferase system, fructose-specific IIBC component  61.01 
 
 
584 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2443  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  62.76 
 
 
562 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00688862  normal  0.279017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0823  phosphotransferase system PTS, fructose-specific IIB subunit:PTS fructose IIC component  61.16 
 
 
580 aa  682    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0795  PTS fructose IIC component  60.46 
 
 
577 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.417507  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2646  phosphotransferase system, fructose IIC component  61.34 
 
 
587 aa  695    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00238741  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0829  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  61.91 
 
 
580 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.645522  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1654  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  64.71 
 
 
563 aa  668    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0114872  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3553  PTS system fructose-specific IIBC protein  73.45 
 
 
575 aa  840    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.869517  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000224  phosphotransferase system fructose-specific IIB and IIC subunit  77.26 
 
 
579 aa  892    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2761  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  64.57 
 
 
563 aa  659    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0788  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  61.55 
 
 
574 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0449  PTS system, fructose-specific IIBC component  100 
 
 
580 aa  1157    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1926  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  64.54 
 
 
563 aa  668    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0818  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  61.74 
 
 
580 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2681  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  65.71 
 
 
566 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000131173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2440  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  63.13 
 
 
562 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29785  hitchhiker  0.0000687428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4398  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  60.79 
 
 
579 aa  651    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0092  PTS system, fructose-specific IIBC component  75.74 
 
 
579 aa  891    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05960  PTS system fructose-specific IIBC component  76.8 
 
 
581 aa  892    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2396  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  62.76 
 
 
562 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000856102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2304  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  63.55 
 
 
563 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000200462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0796  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  63.53 
 
 
563 aa  654    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00918032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02055  hypothetical protein  63.55 
 
 
563 aa  659    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0551082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3303  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  63.53 
 
 
563 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000185462  normal  0.0412647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2314  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  63.53 
 
 
563 aa  654    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00422844  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1526  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  66.09 
 
 
566 aa  672    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032723  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2464  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  63.36 
 
 
563 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000333073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2762  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  65.9 
 
 
566 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.913344  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2327  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  64.12 
 
 
562 aa  654    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2424  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  63.96 
 
 
563 aa  650    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3228  PTS system fructose-specific transporter subunits IIBC  65.23 
 
 
561 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4139  PTS system fructose-specific transporter subunit EIIBC  72.31 
 
 
457 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256781  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4067  pts system fructose-specific eiibc component  71.65 
 
 
457 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12210  Fructose phosphotransferase system IIBC component  59.89 
 
 
579 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.487612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18275  phosphotransferase system, fructose-specific IIBC component  57.94 
 
 
585 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0239458  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1585  phosphotransferase system, fructose-specific IIBC component  57.77 
 
 
585 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0013  PTS fructose IIC component  59 
 
 
462 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.991255  unclonable  0.00000000838432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2897  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  58.57 
 
 
483 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.78081  hitchhiker  0.0087232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4714  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  59.17 
 
 
483 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1717  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  60.92 
 
 
456 aa  511  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.315956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0578  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  58.06 
 
 
452 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000494031  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0908  protein-N p-phosphohistidine-sugar phosphotransferase  50.27 
 
 
595 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.011028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0149  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  58.13 
 
 
454 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1970  PTS fructose IIC component  48.94 
 
 
575 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2175  phosphotransferase system, fructose IIC component  50.34 
 
 
607 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2863  PTS system, fructose-specific IIBC component (EIIBC-fru) (fructose-permease IIBC component) transmembrane protein  53.81 
 
 
573 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24563  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0639  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  57.68 
 
 
456 aa  481  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.392906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3406  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  54.61 
 
 
462 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0171984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2745  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  53.51 
 
 
571 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.853205  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3110  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  53.51 
 
 
571 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4250  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  55.15 
 
 
602 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401308  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0612  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  47.11 
 
 
579 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00489  pts system fructose-specific eiibc component (eiibc-fru) (eii-fru)  48.25 
 
 
580 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1189  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  47.88 
 
 
574 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1788  PTS system fructose-specific II BC component  47.2 
 
 
581 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2665  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  49.61 
 
 
575 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.079848  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0189  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  53.91 
 
 
564 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0564  PTS system, fructose-specific, IIABC component  47.27 
 
 
630 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2032  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  53.12 
 
 
568 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1512  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  51.83 
 
 
623 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350477  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0550  fructose specific permease  49.45 
 
 
630 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2649  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  48.45 
 
 
623 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0435  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  47.69 
 
 
581 aa  439  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165836  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0649  pts system, fructose-specific iiabc component  48.37 
 
 
623 aa  426  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.83656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2394  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  48.35 
 
 
618 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3482  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  47.69 
 
 
619 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0610802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3563  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  47.69 
 
 
622 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0301222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3462  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  47.69 
 
 
619 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000328489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3476  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  47.91 
 
 
619 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3846  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  47.69 
 
 
626 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000062066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3816  PTS system, fructose-specific IIABC component  48.13 
 
 
618 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000120874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1486  PTS system, fructose-specific IIABC component  47.91 
 
 
618 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00732656  hitchhiker  0.00389815 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3726  PTS system, fructose-specific IIABC component  47.69 
 
 
618 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2187600000000001e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3744  PTS system, fructose-specific IIABC component  47.69 
 
 
618 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000405115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0588  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  48.67 
 
 
626 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3767  PTS system, fructose-specific IIABC component  47.69 
 
 
619 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0892  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  47.15 
 
 
469 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1684  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  45.6 
 
 
464 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2665  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  45.34 
 
 
650 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2721  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  45.34 
 
 
650 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1170  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  45.14 
 
 
648 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0724  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  45.08 
 
 
652 aa  363  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0740  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  45.08 
 
 
652 aa  363  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3394  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  43.28 
 
 
467 aa  363  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0411  pts system, fructose-specific iiabc component  44.06 
 
 
625 aa  362  1e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0359  PTS system, fructose-specific IIABC components  45.61 
 
 
650 aa  361  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0110  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  44.42 
 
 
617 aa  361  2e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0066  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  43.76 
 
 
503 aa  360  5e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411939  normal  0.45424 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05184  PTS system fructose-specific IIABC component  43.36 
 
 
635 aa  357  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001305  phosphotransferase system fructose-specific  43.75 
 
 
635 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3758  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  45.12 
 
 
634 aa  355  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0506  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  45.56 
 
 
469 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0755298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>