More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0999 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1815  aspartyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 598 aa  636    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 617 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 592 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 595 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163507  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 599 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 591 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 591 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  81.46 
 
 		 583 aa  994    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 591 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 598 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 592 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 598 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 596 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0999  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 589 aa  1214    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0326793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 592 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000241226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 599 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 591 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 594 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 599 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1887  aspartyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 593 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00122802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2262  aspartyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 596 aa  649    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.410754  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 598 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 594 aa  657    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 597 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1898  aspartyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 591 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0452698  hitchhiker  0.00737788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2080  aspartyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 591 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108911  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 592 aa  650    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 598 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01552  aspartyl-tRNA synthetase  82.47 
 
 		 588 aa  997    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1108  aspartyl-tRNA synthetase  98.13 
 
 		 589 aa  1193    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000320329  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 591 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 591 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2040  aspartyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 592 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00291501  hitchhiker  0.000000115872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2160  aspartyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 601 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 591 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 623 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 591 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 590 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 592 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000667018  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 586 aa  634  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 590 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 599 aa  632  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 590 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 590 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 623 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 599 aa  633  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 		 595 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 590 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 591 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 605 aa  628  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 600 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 600 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 593 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 600 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 591 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 598 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 592 aa  631  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 590 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 611 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 601 aa  629  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1223  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 585 aa  630  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106178  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 592 aa  630  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 600 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 600 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 593 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 593 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 588 aa  626  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 600 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 594 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 592 aa  625  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2184  aspartyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 591 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 590 aa  628  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 600 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 600 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 597 aa  623  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 600 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 600 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 600 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 600 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 591 aa  623  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 604 aa  622  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 599 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 590 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 599 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 590 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 596 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 590 aa  620  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 590 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 596 aa  618  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 600 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 600 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 591 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 590 aa  620  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 596 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 590 aa  618  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1886  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 591 aa  615  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 608 aa  616  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 592 aa  615  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 590 aa  618  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>